211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2586 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2586  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 126 aa  254  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000628471  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  91.38 
 
 		 197 aa  220  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  66.36 
 
 		 191 aa  167  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  66.36 
 
 		 191 aa  166  7e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  64.22 
 
 		 197 aa  154  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  61.82 
 
 		 199 aa  148  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 196 aa  140  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  59.09 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  55.45 
 
 		 215 aa  137  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  57.14 
 
 		 202 aa  136  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1719  transcriptional regulator, XRE family  54.95 
 
 		 204 aa  133  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.017651  normal  0.124941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  53.57 
 
 		 201 aa  130  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  54.05 
 
 		 198 aa  127  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1965  XRE family transcriptional regulator  52.68 
 
 		 194 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0249499  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  50.88 
 
 		 223 aa  122  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  54.46 
 
 		 194 aa  122  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  57.14 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  50.43 
 
 		 200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  49.58 
 
 		 201 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 219 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  50.45 
 
 		 200 aa  114  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1711  transcriptional regulator, XRE family  52.25 
 
 		 200 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63161  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  49.11 
 
 		 197 aa  110  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  46.79 
 
 		 192 aa  110  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  47.27 
 
 		 191 aa  108  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  53.57 
 
 		 194 aa  107  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1667  XRE family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 214 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  48.21 
 
 		 198 aa  101  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2592  transcriptional regulator, XRE family  51.33 
 
 		 210 aa  98.2  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4050  transcriptional regulator, XRE family  48.21 
 
 		 192 aa  97.8  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2893  XRE family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 169 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 190 aa  96.3  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3617  XRE family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 195 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 193 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 193 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 193 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  47.83 
 
 		 195 aa  88.2  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2365  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.0272358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  38.05 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  39.33 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  48.65 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  39.81 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 198 aa  60.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  30.88 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  38.55 
 
 		 190 aa  57  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2440  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086441  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 281 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 286 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 292 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  36.47 
 
 		 193 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  40.26 
 
 		 188 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2941  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 271 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0631546  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0609  cupin sensor transcriptional regulator  33.82 
 
 		 184 aa  50.8  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176567  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3075  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 269 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  34.62 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1077  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2356  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 188 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.190302 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 192 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3049  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 259 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258201 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0869  XRE family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 197 aa  48.9  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2732  XRE family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 180 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2591  XRE family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2416  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 259 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3030  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 259 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 192 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4834  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.197047  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 201 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 192 aa  47.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  30.14 
 
 		 191 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3161  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 182 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 204 aa  47.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0698  DNA-binding protein  37.1 
 
 		 247 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0375351  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2423  DNA-binding protein  37.1 
 
 		 247 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1444  cupin 2 domain-containing protein  28.36 
 
 		 192 aa  47.4  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0768  DNA-binding protein  37.1 
 
 		 242 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1221  DNA-binding protein  37.1 
 
 		 247 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563936  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1146  DNA-binding protein  37.1 
 
 		 247 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112687  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1732  DNA-binding protein  37.1 
 
 		 247 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3125  Cro/CI family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 180 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0992  cupin 2 domain-containing protein  48.72 
 
 		 186 aa  47.4  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00214756  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  28.36 
 
 		 192 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 191 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 180 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  31.33 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.26 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0817  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 184 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1039  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 193 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3411  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 183 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1468  transcriptional regulator, XRE family  33.96 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0100935  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1575  DNA-binding protein  35.48 
 
 		 249 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>