240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2893 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2893  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 169 aa  338  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3617  XRE family transcriptional regulator  90.53 
 
 		 195 aa  313  8e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  75.9 
 
 		 193 aa  266  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  75.9 
 
 		 193 aa  266  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  75.9 
 
 		 193 aa  266  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4050  transcriptional regulator, XRE family  67.68 
 
 		 192 aa  228  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 196 aa  152  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  47.56 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  48.17 
 
 		 197 aa  140  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1965  XRE family transcriptional regulator  49.7 
 
 		 194 aa  140  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0249499  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1719  transcriptional regulator, XRE family  47.34 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.017651  normal  0.124941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  47.31 
 
 		 192 aa  137  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  47.88 
 
 		 200 aa  136  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  47.02 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  47.27 
 
 		 199 aa  134  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1711  transcriptional regulator, XRE family  46.34 
 
 		 200 aa  134  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63161  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 198 aa  131  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  46.34 
 
 		 191 aa  131  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  46.06 
 
 		 191 aa  130  7.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  46.06 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  45.56 
 
 		 195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 219 aa  128  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  44.31 
 
 		 201 aa  127  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  43.53 
 
 		 194 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  44.58 
 
 		 223 aa  124  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  41.72 
 
 		 192 aa  124  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  44.05 
 
 		 197 aa  124  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  42.07 
 
 		 192 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  42.35 
 
 		 197 aa  119  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  46.47 
 
 		 194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  43.35 
 
 		 198 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  42.01 
 
 		 196 aa  116  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2592  transcriptional regulator, XRE family  47.56 
 
 		 210 aa  114  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  44.23 
 
 		 201 aa  114  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1667  XRE family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 214 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  40.36 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  39.63 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 195 aa  106  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  39.16 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  40.59 
 
 		 194 aa  104  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2586  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.65 
 
 		 126 aa  97.1  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000628471  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2365  transcriptional regulator, XRE family  38.79 
 
 		 193 aa  94.4  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.0272358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  36.59 
 
 		 188 aa  91.7  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  34.57 
 
 		 198 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2440  transcriptional regulator, XRE family  33.92 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086441  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  34.3 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 191 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 191 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 191 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  28.82 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  26.19 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3075  XRE family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 269 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  27.61 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2941  XRE family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0631546  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 292 aa  57.8  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2038  transcriptional regulator  24.18 
 
 		 230 aa  57.4  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.547476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1575  DNA-binding protein  27.67 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1565  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  23.67 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  27.08 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  25.32 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1064  transciptional regulator  23.65 
 
 		 195 aa  53.9  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0925  transcriptional regulator, putative  26.42 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0867  putative transcriptional regulator  26.42 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0318952  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 192 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 192 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 180 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  28.39 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  25.69 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2245  Cro/CI family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 197 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492638  normal  0.683994 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2858  transcriptional regulator, XRE family  25.66 
 
 		 215 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000622832  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3493  XRE family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 197 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.499359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3586  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 207 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 286 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  30.97 
 
 		 201 aa  52.4  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  26 
 
 		 190 aa  52.4  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 201 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1444  cupin 2 domain-containing protein  22.88 
 
 		 192 aa  51.6  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1443  XRE family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 182 aa  51.6  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  26 
 
 		 193 aa  51.2  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 189 aa  51.2  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  24.07 
 
 		 211 aa  51.2  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1035  transcriptional regulator, XRE family  23.29 
 
 		 179 aa  51.2  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1466  XRE family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 206 aa  50.8  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.609185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  22.16 
 
 		 189 aa  50.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0992  cupin 2 domain-containing protein  22.67 
 
 		 186 aa  50.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00214756  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  24.29 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  28.66 
 
 		 204 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>