More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2592 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2592  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 210 aa  416  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  70.62 
 
 		 195 aa  262  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  65.82 
 
 		 198 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  67.89 
 
 		 202 aa  249  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  68.75 
 
 		 201 aa  249  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  65.66 
 
 		 196 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  67.01 
 
 		 215 aa  239  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  62.83 
 
 		 194 aa  238  6.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1667  XRE family transcriptional regulator  62.89 
 
 		 214 aa  228  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  62.3 
 
 		 201 aa  226  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  63.49 
 
 		 198 aa  226  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  60 
 
 		 219 aa  224  7e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  63.24 
 
 		 197 aa  224  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1719  transcriptional regulator, XRE family  67.38 
 
 		 204 aa  223  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.017651  normal  0.124941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  62.05 
 
 		 200 aa  223  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  63.19 
 
 		 192 aa  221  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  65.26 
 
 		 195 aa  221  9e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  59.26 
 
 		 199 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  57.79 
 
 		 223 aa  214  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1965  XRE family transcriptional regulator  61.38 
 
 		 194 aa  214  8e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0249499  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 191 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  61.75 
 
 		 200 aa  212  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  60.73 
 
 		 194 aa  208  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  58.06 
 
 		 192 aa  207  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  54.17 
 
 		 191 aa  206  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  55.56 
 
 		 191 aa  196  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  53.19 
 
 		 197 aa  193  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  54.05 
 
 		 197 aa  192  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1711  transcriptional regulator, XRE family  54.5 
 
 		 200 aa  171  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63161  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  50.8 
 
 		 190 aa  166  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2365  transcriptional regulator, XRE family  56.91 
 
 		 193 aa  160  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.0272358 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 193 aa  157  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 193 aa  157  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 193 aa  157  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3617  XRE family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 195 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2893  XRE family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 169 aa  135  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4050  transcriptional regulator, XRE family  47.56 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  40.74 
 
 		 196 aa  121  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  41.01 
 
 		 192 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2586  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 126 aa  112  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000628471  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  41.9 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  41.34 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  40.54 
 
 		 194 aa  105  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  39.57 
 
 		 201 aa  99  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  35.45 
 
 		 198 aa  89.4  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  34.07 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  29.79 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0062  transcriptional regulator  32.45 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 180 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0869  XRE family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1227  transcriptional regulator  31.38 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0477  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  35.6 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  27.03 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5469  XRE family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381278  normal  0.011752 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  31.75 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  30.06 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  29.89 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  32.22 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  30.06 
 
 		 187 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  32.95 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  30.41 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3075  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 269 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  29.78 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2440  transcriptional regulator, XRE family  34.5 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086441  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2601  XRE family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512754  hitchhiker  0.000000366247 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4870  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.523431 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05970  hypothetical protein  27.27 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2727  DNA-binding transcriptional regulator  26.34 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118237 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  24.18 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1906  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2941  XRE family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 271 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0631546  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000231  predicted transcriptional regulator  26.98 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  29.61 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 187 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1035  transcriptional regulator, XRE family  27.78 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  28.86 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1444  cupin 2 domain-containing protein  27.81 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3046  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 191 aa  62  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  26.92 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  27.53 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  28.18 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1430  XRE family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776927 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>