More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3050 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 195 aa  380  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  69.31 
 
 		 194 aa  259  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  66.84 
 
 		 198 aa  256  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  68.59 
 
 		 196 aa  251  4.0000000000000004e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  68.95 
 
 		 201 aa  251  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  67.02 
 
 		 215 aa  248  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  67.38 
 
 		 202 aa  245  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1667  XRE family transcriptional regulator  66.32 
 
 		 214 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2592  transcriptional regulator, XRE family  70.62 
 
 		 210 aa  238  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  61.14 
 
 		 199 aa  234  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  59.69 
 
 		 191 aa  232  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  65.93 
 
 		 192 aa  231  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1965  XRE family transcriptional regulator  65.78 
 
 		 194 aa  231  7.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0249499  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  63.08 
 
 		 223 aa  229  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  59.16 
 
 		 191 aa  228  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  62.5 
 
 		 201 aa  226  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  65.46 
 
 		 194 aa  226  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1719  transcriptional regulator, XRE family  65.46 
 
 		 204 aa  226  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.017651  normal  0.124941 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  68.11 
 
 		 195 aa  224  6e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  63.93 
 
 		 200 aa  222  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  60 
 
 		 219 aa  222  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  61.7 
 
 		 197 aa  221  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  63.59 
 
 		 198 aa  218  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  60.56 
 
 		 192 aa  217  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  62.16 
 
 		 191 aa  217  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  60.94 
 
 		 200 aa  215  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  54.82 
 
 		 197 aa  209  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  59.56 
 
 		 197 aa  208  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1711  transcriptional regulator, XRE family  64.36 
 
 		 200 aa  202  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63161  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  53.68 
 
 		 190 aa  185  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2365  transcriptional regulator, XRE family  56.1 
 
 		 193 aa  162  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.0272358 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 193 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 193 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 193 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2893  XRE family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 169 aa  129  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3617  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 195 aa  128  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4050  transcriptional regulator, XRE family  45.73 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2586  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.14 
 
 		 126 aa  122  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000628471  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 192 aa  115  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  38.25 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  38.51 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  40.45 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 194 aa  101  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  37.08 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 198 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  33.53 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  36.52 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  39.25 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  30.64 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  30.64 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  35.84 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  32.77 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2440  transcriptional regulator, XRE family  35.26 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086441  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  34.46 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  30.17 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  29.61 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  28.04 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  29.38 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5469  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381278  normal  0.011752 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  30.9 
 
 		 182 aa  72  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 292 aa  71.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  28.65 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0062  transcriptional regulator  32.24 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  27.57 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3075  XRE family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  30.34 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1046  XRE family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3049  XRE family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258201 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  28.09 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3161  XRE family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2416  XRE family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3030  XRE family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2941  XRE family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0631546  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  29.48 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 276 aa  68.2  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  28.96 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  25.82 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  29.78 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0477  XRE family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4834  transcriptional regulator, XRE family  31.46 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.197047  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0925  transcriptional regulator, putative  26.7 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3411  transcriptional regulator, XRE family  30.51 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0867  putative transcriptional regulator  26.7 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0318952  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 292 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>