More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2613 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  434  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  86.43 
 
 		 201 aa  347  8e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  85.57 
 
 		 197 aa  332  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  74.02 
 
 		 200 aa  295  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  62.5 
 
 		 202 aa  252  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  65.61 
 
 		 201 aa  246  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  67.93 
 
 		 200 aa  244  8e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  64 
 
 		 196 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  64.55 
 
 		 215 aa  238  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  62.11 
 
 		 198 aa  237  8e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1965  XRE family transcriptional regulator  65.61 
 
 		 194 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0249499  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  60.32 
 
 		 194 aa  231  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  63.64 
 
 		 194 aa  230  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  60 
 
 		 195 aa  222  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1719  transcriptional regulator, XRE family  62.89 
 
 		 204 aa  221  7e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.017651  normal  0.124941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  59.26 
 
 		 192 aa  221  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  58.55 
 
 		 192 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  59.28 
 
 		 195 aa  211  5.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  56.45 
 
 		 191 aa  209  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  56.99 
 
 		 198 aa  206  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  56.91 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 191 aa  202  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  53.19 
 
 		 197 aa  201  7e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2592  transcriptional regulator, XRE family  60 
 
 		 210 aa  199  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  52.66 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  51.05 
 
 		 191 aa  196  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1667  XRE family transcriptional regulator  54.63 
 
 		 214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  53.63 
 
 		 197 aa  188  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  52.46 
 
 		 190 aa  185  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1711  transcriptional regulator, XRE family  55.79 
 
 		 200 aa  184  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63161  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 193 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 193 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 193 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2365  transcriptional regulator, XRE family  54.14 
 
 		 193 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.0272358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3617  XRE family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4050  transcriptional regulator, XRE family  47.31 
 
 		 192 aa  131  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2893  XRE family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 169 aa  128  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  44.13 
 
 		 201 aa  124  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2586  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.21 
 
 		 126 aa  114  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000628471  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  36.87 
 
 		 196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 192 aa  108  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 194 aa  105  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  40.34 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  39.46 
 
 		 190 aa  102  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2440  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 220 aa  92  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086441  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 198 aa  88.2  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 201 aa  88.6  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  35.57 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2038  transcriptional regulator  30.25 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.547476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  31.43 
 
 		 188 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1064  transciptional regulator  26.67 
 
 		 195 aa  72  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0551  transcriptional regulator, XRE family  32.32 
 
 		 198 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  31.18 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  29.31 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  29.38 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  28.98 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  28.98 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  24.86 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 187 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5469  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381278  normal  0.011752 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0477  XRE family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3075  XRE family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  25.53 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2591  XRE family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 292 aa  65.1  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  28.66 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  28.16 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  28.16 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  28.16 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  28.16 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  28.16 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2318  transcriptional regulator  27.84 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00466136  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3049  XRE family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258201 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  28.16 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>