More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1965 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1965  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  387  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0249499  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  70.31 
 
 		 202 aa  278  5e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  69.11 
 
 		 201 aa  274  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  67.54 
 
 		 198 aa  267  8e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 196 aa  266  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  66.15 
 
 		 215 aa  257  8e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  64.95 
 
 		 194 aa  255  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  68.78 
 
 		 194 aa  254  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  64.92 
 
 		 201 aa  250  9.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  65.61 
 
 		 219 aa  248  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  65.78 
 
 		 195 aa  246  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  64.92 
 
 		 197 aa  242  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  66.49 
 
 		 200 aa  239  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  64.67 
 
 		 192 aa  238  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1719  transcriptional regulator, XRE family  67.2 
 
 		 204 aa  235  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.017651  normal  0.124941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  59.89 
 
 		 223 aa  229  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  58.29 
 
 		 192 aa  226  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  59.67 
 
 		 191 aa  223  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 191 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  56.25 
 
 		 191 aa  220  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  60.11 
 
 		 200 aa  219  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  58.01 
 
 		 197 aa  215  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  55.98 
 
 		 199 aa  213  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  63.04 
 
 		 195 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  56.61 
 
 		 198 aa  207  6e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1667  XRE family transcriptional regulator  59.59 
 
 		 214 aa  207  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2592  transcriptional regulator, XRE family  61.38 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  53.8 
 
 		 197 aa  198  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  53.55 
 
 		 190 aa  191  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1711  transcriptional regulator, XRE family  54.1 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63161  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 193 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 193 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 193 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4050  transcriptional regulator, XRE family  52.12 
 
 		 192 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2365  transcriptional regulator, XRE family  50.31 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.0272358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2893  XRE family transcriptional regulator  49.7 
 
 		 169 aa  152  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3617  XRE family transcriptional regulator  48.5 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2586  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.68 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000628471  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  40.74 
 
 		 192 aa  118  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  39.89 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  37.89 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  43.93 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  39.46 
 
 		 190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  39.01 
 
 		 193 aa  108  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  35.35 
 
 		 198 aa  92  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2440  transcriptional regulator, XRE family  39.79 
 
 		 220 aa  92  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086441  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  32.8 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  36.26 
 
 		 186 aa  77.8  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  31.79 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0551  transcriptional regulator, XRE family  29.12 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  28.73 
 
 		 191 aa  72  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2038  transcriptional regulator  27.87 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.547476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  29.35 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  25.57 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  25.57 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  27.37 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3049  XRE family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258201 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2416  XRE family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3030  XRE family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  27.22 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  24.73 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3046  transcriptional regulator  27.53 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5469  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381278  normal  0.011752 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  31.55 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  27.98 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  28.22 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  28.11 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  26.74 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1064  transciptional regulator  26.04 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  25.68 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  27.65 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  27.12 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  34.12 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  28.9 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1227  transcriptional regulator  30.18 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3075  XRE family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0168  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  29.02 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  27.61 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  28.95 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1819  transcriptional regulator, XRE family  27.87 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.3413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>