More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3617 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3617  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  391  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2893  XRE family transcriptional regulator  90.53 
 
 		 169 aa  313  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  75.65 
 
 		 193 aa  302  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  75.65 
 
 		 193 aa  302  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  75.65 
 
 		 193 aa  302  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4050  transcriptional regulator, XRE family  65.97 
 
 		 192 aa  236  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  50.28 
 
 		 196 aa  160  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  47.64 
 
 		 200 aa  155  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  48.44 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  47.59 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1965  XRE family transcriptional regulator  48.4 
 
 		 194 aa  150  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0249499  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  47.87 
 
 		 192 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  46.52 
 
 		 202 aa  147  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 219 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  47.67 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  47.75 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  47.43 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  44.74 
 
 		 201 aa  143  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  46.52 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  44.9 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 191 aa  140  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  43.01 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  44.74 
 
 		 194 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  41.44 
 
 		 192 aa  138  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  44.68 
 
 		 197 aa  138  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1719  transcriptional regulator, XRE family  46.75 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.017651  normal  0.124941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  47.45 
 
 		 194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  43.01 
 
 		 196 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  43.58 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  42.64 
 
 		 223 aa  131  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  42.93 
 
 		 197 aa  131  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  41.44 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1711  transcriptional regulator, XRE family  46.34 
 
 		 200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63161  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 193 aa  128  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  45.05 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2592  transcriptional regulator, XRE family  46.6 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1667  XRE family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  39.89 
 
 		 194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  48.02 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 188 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  39.25 
 
 		 190 aa  108  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  38.27 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2586  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.58 
 
 		 126 aa  92.8  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000628471  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2365  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 193 aa  92  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.0272358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2440  transcriptional regulator, XRE family  33.15 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086441  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3075  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 220 aa  72  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2941  XRE family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 271 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0631546  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  28.92 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  29.31 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  29.09 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2245  Cro/CI family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492638  normal  0.683994 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3493  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.499359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2038  transcriptional regulator  26.22 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.547476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  26.29 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4802  helix-turn-helix domain protein  27.27 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329061  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  24.85 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3049  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258201 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2858  transcriptional regulator, XRE family  27.54 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000622832  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  31.46 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2416  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3030  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  25.88 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1444  cupin 2 domain-containing protein  23.31 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  27.07 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 286 aa  62  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  32.53 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1876  XRE family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1466  XRE family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.609185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  25.75 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  27.88 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  27.33 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  22.73 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1064  transciptional regulator  24.39 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  25.7 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  25.61 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>