More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3035 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  428  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  74.87 
 
 		 200 aa  314  7e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  52.66 
 
 		 213 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  57.07 
 
 		 218 aa  226  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 220 aa  222  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  58.15 
 
 		 212 aa  222  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 198 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3469  XRE family transcriptional regulator  51.63 
 
 		 197 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2246  XRE family transcriptional regulator  50.54 
 
 		 197 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2272  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  50 
 
 		 201 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306888  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2581  DNA-binding protein  49.46 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2038  transcriptional regulator  51.96 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.547476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  44.28 
 
 		 219 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4897  XRE family transcriptional regulator  44.28 
 
 		 219 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  44.28 
 
 		 219 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1295  XRE family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 222 aa  175  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3301  XRE family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5514  XRE family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 222 aa  174  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 227 aa  174  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  46.35 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  44.17 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  45.55 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2625  transcriptional regulator, XRE family  45.19 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 201 aa  168  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 201 aa  168  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4802  helix-turn-helix domain protein  43.62 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329061  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2858  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000622832  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  44.92 
 
 		 201 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  44.92 
 
 		 201 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  44.68 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 219 aa  157  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  41.58 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4694  XRE family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607677 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0551  transcriptional regulator, XRE family  40.1 
 
 		 198 aa  148  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3519  transcriptional regulator, XRE family  41.62 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  36.26 
 
 		 187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5954  transcriptional regulator, XRE family  37.36 
 
 		 187 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  37.36 
 
 		 190 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4533  transcriptional regulator, XRE family  38.79 
 
 		 173 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4562  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 173 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  35.16 
 
 		 190 aa  111  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4528  transcriptional regulator, XRE family  37.58 
 
 		 173 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4828  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0464638  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5833  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 173 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  32.42 
 
 		 182 aa  104  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 187 aa  90.9  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0817  transcriptional regulator, XRE family  31.21 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.04 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0552  transcriptional regulator  29.67 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0032692  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  31.52 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  29.76 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0154  XRE family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0108  transcriptional regulator, XRE family  29.67 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1039  MerR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  27.49 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  24.73 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  27.49 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3096  transcriptional regulator, XRE family  23.53 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00124629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4838  transcriptional regulator, XRE family  28.4 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0168811  hitchhiker  0.0000750229 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  29.23 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  27.66 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0587  cupin 2 domain-containing protein  29.51 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  29.23 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0992  cupin 2 domain-containing protein  29.65 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00214756  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0898  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0316  cupin 2 domain-containing protein  28.96 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 286 aa  72  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  28.09 
 
 		 181 aa  72  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  29.51 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2318  transcriptional regulator  29.21 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00466136  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  24.6 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2416  XRE family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 259 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3030  XRE family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 259 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1398  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.365461  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3049  XRE family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258201 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  27.55 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0521  cupin 2 domain-containing protein  28.42 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  29.26 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1468  transcriptional regulator, XRE family  29.28 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0100935  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0869  XRE family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5469  XRE family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381278  normal  0.011752 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 281 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0002  transcriptional regulator, XRE family  28.49 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138514 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0609  cupin sensor transcriptional regulator  26.37 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176567  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1819  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.3413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>