More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0609 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0609  cupin sensor transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  377  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176567  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1398  XRE family transcriptional regulator  63.04 
 
 		 184 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.365461  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0316  cupin 2 domain-containing protein  62.5 
 
 		 184 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0521  cupin 2 domain-containing protein  62.5 
 
 		 184 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1243  transcriptional regulator  62.5 
 
 		 184 aa  250  7e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0587  cupin 2 domain-containing protein  60.33 
 
 		 184 aa  244  4e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2171  transcriptional regulator  63.04 
 
 		 184 aa  243  8e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.809699 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0154  XRE family transcriptional regulator  59.78 
 
 		 182 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0552  transcriptional regulator  53.8 
 
 		 183 aa  204  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0032692  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0495  transcriptional regulator, XRE family  49.46 
 
 		 184 aa  197  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0817  transcriptional regulator, XRE family  41.57 
 
 		 184 aa  158  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0108  transcriptional regulator, XRE family  41.53 
 
 		 186 aa  157  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1468  transcriptional regulator, XRE family  40.76 
 
 		 182 aa  147  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0100935  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2318  transcriptional regulator  39.55 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00466136  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0002  transcriptional regulator, XRE family  36.26 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138514 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1709  transcriptional regulator, XRE family  39.04 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0992  cupin 2 domain-containing protein  38.42 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00214756  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17340  cupin domain-containing protein  36.26 
 
 		 186 aa  126  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1702  transcriptional regulator, XRE family  33.88 
 
 		 183 aa  117  9e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07930  cupin domain-containing protein  38.46 
 
 		 194 aa  114  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.409576 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17550  putative transcriptional regulator with cupin domain  34.41 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 192 aa  84.7  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  29.03 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1819  transcriptional regulator, XRE family  28.65 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.3413 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  28.65 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  28.04 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0402  transcriptional regulator, XRE family  26.88 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.699228  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1444  cupin 2 domain-containing protein  28.49 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  26.49 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1559  transcriptional regulator, XRE family  27.68 
 
 		 262 aa  72  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1039  MerR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3886  XRE family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1110  Phosphate butyryltransferase  27.78 
 
 		 503 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  25.7 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  31.79 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  28.4 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6754  transcriptional regulator, XRE family  28.49 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36173  normal  0.846385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3151  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.53 
 
 		 503 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  23.89 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  29.51 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  28.65 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  28.65 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  22.91 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1430  XRE family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776927 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0867  DNA-binding protein  28.81 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1956  DNA-binding protein  28.81 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0281  DNA-binding protein  28.81 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0958  DNA-binding protein  28.81 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704462  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2769  XRE family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 276 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 208 aa  67.8  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  28.81 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  28.81 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  27.96 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  27.42 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4798  transcriptional regulator  27.98 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4609  XRE family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  25.81 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  27.17 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  26.53 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  25.93 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  26.53 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7013  transcriptional regulator  33.96 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05970  hypothetical protein  25.7 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2732  XRE family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  27.42 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  27.89 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2038  transcriptional regulator  27.62 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.547476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1469  XRE family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.978322 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5085  XRE family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 251 aa  64.7  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00667568  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3125  Cro/CI family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5469  XRE family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381278  normal  0.011752 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  28.25 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000231  predicted transcriptional regulator  25.56 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2591  XRE family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  27.27 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  25.54 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  26.09 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>