162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_17550 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_17550  putative transcriptional regulator with cupin domain  100 
 
 		 200 aa  407  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1709  transcriptional regulator, XRE family  73.3 
 
 		 193 aa  287  6e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07930  cupin domain-containing protein  64.06 
 
 		 194 aa  250  9.000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.409576 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0002  transcriptional regulator, XRE family  39.47 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138514 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0552  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 183 aa  125  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0032692  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0495  transcriptional regulator, XRE family  36.56 
 
 		 184 aa  122  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0992  cupin 2 domain-containing protein  33.7 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00214756  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1243  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0609  cupin sensor transcriptional regulator  34.41 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176567  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0521  cupin 2 domain-containing protein  35.48 
 
 		 184 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0154  XRE family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 182 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1398  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 184 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.365461  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2318  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00466136  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0316  cupin 2 domain-containing protein  35.48 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2171  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 184 aa  106  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.809699 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0587  cupin 2 domain-containing protein  35.48 
 
 		 184 aa  105  6e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0108  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 186 aa  104  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0817  transcriptional regulator, XRE family  31.55 
 
 		 184 aa  96.3  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1468  transcriptional regulator, XRE family  31.18 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0100935  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  27.46 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  28.34 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2625  transcriptional regulator, XRE family  28.88 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  29.53 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  26.98 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4694  XRE family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607677 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3301  XRE family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17340  cupin domain-containing protein  25.14 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  26.04 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1702  transcriptional regulator, XRE family  27.22 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  25.93 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  27.55 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  27.55 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0551  transcriptional regulator, XRE family  27.37 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  29.23 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  26.77 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4802  helix-turn-helix domain protein  29.69 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329061  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1227  transcriptional regulator  25.13 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1039  MerR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1444  cupin 2 domain-containing protein  29.15 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  28.42 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  29 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.73 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  27.13 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0168  XRE family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  27.66 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2858  transcriptional regulator, XRE family  28.12 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000622832  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  28.34 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  28.95 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  31.58 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4897  XRE family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1295  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  28.88 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  28.88 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2245  Cro/CI family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492638  normal  0.683994 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3493  XRE family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.499359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  28.42 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  28.42 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  27.36 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1876  XRE family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2007  DNA-binding protein  26.67 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  28.4 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1430  XRE family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 259 aa  52  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4562  transcriptional regulator, XRE family  29.28 
 
 		 173 aa  51.6  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  28.87 
 
 		 188 aa  51.6  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5514  XRE family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3519  transcriptional regulator, XRE family  30.37 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1469  XRE family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.978322 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2769  XRE family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 276 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4528  transcriptional regulator, XRE family  28.25 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1685  cupin 2 domain-containing protein  42.42 
 
 		 141 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5954  transcriptional regulator, XRE family  27.37 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2038  transcriptional regulator  25.79 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.547476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6754  transcriptional regulator, XRE family  25.85 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36173  normal  0.846385 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0079  DNA-binding protein  27.03 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  24.73 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>