44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1685 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1685  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 141 aa  286  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2004  Cupin 2 conserved barrel domain protein  96.45 
 
 		 141 aa  257  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1804  cupin 2 domain-containing protein  80.45 
 
 		 148 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1177  Cupin 2 conserved barrel domain protein  79.1 
 
 		 152 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1566  cupin 2 domain-containing protein  73.38 
 
 		 141 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.826475  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4362  Cupin 2 conserved barrel domain protein  68.79 
 
 		 153 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.951777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1874  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.65 
 
 		 142 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.935294 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0587  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.2 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.90971 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0577  cupin 2 domain-containing protein  59.2 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.4 
 
 		 139 aa  148  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2974  cupin 2 domain-containing protein  43.61 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19982  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  38.03 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  37.33 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17550  putative transcriptional regulator with cupin domain  42.42 
 
 		 200 aa  50.1  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.9 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  36.51 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  28.4 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  36.51 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.49 
 
 		 257 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  38.71 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.7 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3175  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.22 
 
 		 161 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  38.71 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  30.95 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3499  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.22 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.163476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  37.5 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  34.44 
 
 		 190 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3304  signal peptide protein  40 
 
 		 155 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0282721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3098  cupin 2 protein  37.04 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.798535  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0220  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0788  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.9 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.81 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3512  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.29 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  36.51 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  29.69 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2605  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.29 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0523242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.87 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  39.06 
 
 		 190 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2318  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 188 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00466136  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 276 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1270  hypothetical protein  27.59 
 
 		 140 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.7 
 
 		 130 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>