96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0320 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
146 aa  303  6e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.49 
 
 
152 aa  192  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  62.16 
 
 
152 aa  191  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  59.72 
 
 
148 aa  186  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  58.87 
 
 
152 aa  184  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  55.17 
 
 
149 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  34.62 
 
 
163 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.05 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.34 
 
 
160 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  28.87 
 
 
190 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4297  cupin 2 domain-containing protein  34.94 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.36 
 
 
121 aa  54.3  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.05 
 
 
165 aa  53.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.62 
 
 
204 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  34.33 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.62 
 
 
204 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 
192 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.78 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.85 
 
 
184 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1043  cupin 2 domain-containing protein  30.34 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  28.72 
 
 
179 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  27.43 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  30.1 
 
 
163 aa  47.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.87 
 
 
377 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.36 
 
 
163 aa  47  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  30.99 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  30.99 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  30.99 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0666056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  30.99 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  32.94 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  30.99 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29 
 
 
144 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  30.99 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  31.25 
 
 
112 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  30.99 
 
 
120 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  30.99 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  30.99 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  30.99 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  31.82 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  30.99 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  28.38 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  28.17 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4136  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.13 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3746  cupin 2 domain-containing protein  35.21 
 
 
124 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1685  cupin 2 domain-containing protein  29.87 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.78 
 
 
182 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  31.71 
 
 
197 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.66 
 
 
103 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2200  hypothetical protein  29.41 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.192403 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  29.07 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.38 
 
 
332 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.21 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  31.82 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2004  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.87 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  25.56 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0904  hypothetical protein  37.93 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.08 
 
 
181 aa  42  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2605  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.63 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0523242  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3512  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.63 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  37.5 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.74 
 
 
130 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 
199 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  31.65 
 
 
199 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 
199 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.99 
 
 
138 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  28.72 
 
 
158 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  36.73 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4592  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.86 
 
 
112 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3665  hypothetical protein  28.05 
 
 
112 aa  41.2  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  27.78 
 
 
199 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 
204 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3586  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
207 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  30.53 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  31.94 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.51 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  26.83 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.41 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  28.12 
 
 
153 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  32.05 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2053  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.17 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.47 
 
 
421 aa  40.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2852  cupin 2  36.23 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  32.79 
 
 
148 aa  40.4  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  31.88 
 
 
311 aa  40.4  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  26.88 
 
 
111 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2209  MerR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000991087  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2685  cupin 2 domain-containing protein  26.76 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477579  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  30.38 
 
 
199 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  34.21 
 
 
169 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3086  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.51 
 
 
159 aa  40  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.097702  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  29.11 
 
 
129 aa  40  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.62 
 
 
113 aa  40  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  38 
 
 
338 aa  40  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.43 
 
 
113 aa  40  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>