78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5545 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 141 aa  283  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  52.59 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 144 aa  116  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  35.29 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  37.74 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.53 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.99 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.18 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  30.28 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  30.28 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  30.28 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.02 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  30.28 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5660  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.89 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.215719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.34 
 
 		 169 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.5 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  28.44 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.35 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.92 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.5 
 
 		 192 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.42 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  30.15 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  36.63 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  39.18 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  35.11 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.4 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.12 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  36.59 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.19 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  33.7 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  34.88 
 
 		 152 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  29.92 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0028  double-stranded beta-helix-like protein  35.21 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.71 
 
 		 257 aa  47.4  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.96 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  31.33 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  31.33 
 
 		 186 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  44 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  39.39 
 
 		 338 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  32.56 
 
 		 163 aa  46.2  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  33 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  31.33 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  31.33 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2209  MerR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000991087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 286 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  31.33 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.41 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  32.94 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2004  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.94 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  35.14 
 
 		 191 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.14 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.87 
 
 		 163 aa  44.3  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  34.15 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  31.75 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.1 
 
 		 169 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  32.1 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.9 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  31 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3782  hypothetical protein  29.85 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000165271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1685  cupin 2 domain-containing protein  38.71 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3867  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.59 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.468547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  31.4 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3322  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.94 
 
 		 255 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.68 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.52 
 
 		 377 aa  41.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  27.12 
 
 		 138 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.77 
 
 		 130 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  32.05 
 
 		 197 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  25.51 
 
 		 139 aa  41.2  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1447  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.15 
 
 		 190 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.428247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 197 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.24 
 
 		 133 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  48.72 
 
 		 154 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>