41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0109 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 377 aa  781    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.25 
 
 		 389 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0454  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 356 aa  180  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  28.17 
 
 		 338 aa  135  8e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11002  dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07350)  28.91 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.627949  normal  0.657367 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.35 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06772  conserved hypothetical protein  27.34 
 
 		 372 aa  57  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.21 
 
 		 165 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  30.43 
 
 		 163 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.37 
 
 		 149 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.66 
 
 		 192 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  25.44 
 
 		 155 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  31.19 
 
 		 158 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  30.19 
 
 		 145 aa  50.1  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.51 
 
 		 135 aa  50.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.49 
 
 		 153 aa  49.7  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  43.64 
 
 		 158 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087666  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3067  cupin 2 domain-containing protein  28.32 
 
 		 145 aa  47.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  25 
 
 		 332 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  29.87 
 
 		 146 aa  47  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  30.26 
 
 		 166 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  32.63 
 
 		 161 aa  46.6  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  27.43 
 
 		 163 aa  46.2  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  25.2 
 
 		 171 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.75 
 
 		 159 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 197 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.96 
 
 		 159 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  27.12 
 
 		 179 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  29.33 
 
 		 165 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0784  cupin 2 domain-containing protein  28.74 
 
 		 129 aa  43.9  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0399886  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  29.33 
 
 		 165 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  28.28 
 
 		 139 aa  43.9  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  29.33 
 
 		 165 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  28.77 
 
 		 157 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2608  hypothetical protein  26.11 
 
 		 268 aa  43.9  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1340  N-acetylneuraminate synthase  30.77 
 
 		 521 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00426215  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  36.11 
 
 		 186 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5084  cupin superfamily protein  29.52 
 
 		 147 aa  43.1  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259637  normal  0.536671 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  34.72 
 
 		 186 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  29.52 
 
 		 147 aa  43.1  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38 
 
 		 421 aa  43.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>