62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4562 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 153 aa  316  7.999999999999999e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.54 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  40.68 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  32.88 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  31.94 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  33.77 
 
 		 190 aa  63.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.66 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.17 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.49 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.49 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  25.64 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3608  cupin 2 domain-containing protein  32.63 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.88 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.12 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.28 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.98 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  29.92 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.38 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  29.13 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.14 
 
 		 191 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.92 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.49 
 
 		 377 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.43 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.88 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6135  hypothetical protein  25.45 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.715074  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.09 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  22.43 
 
 		 389 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  27.97 
 
 		 338 aa  47  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.36 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0454  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25 
 
 		 356 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3499  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.59 
 
 		 161 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.163476 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1329  mannose-6-phosphate isomerase  28.28 
 
 		 112 aa  44.3  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0501  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3175  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.59 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  30.43 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.84 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11002  dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07350)  24 
 
 		 355 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.627949  normal  0.657367 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2884  XRE family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0819457  normal  0.480487 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  29.09 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2898  XRE family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.75 
 
 		 421 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5084  cupin superfamily protein  25.93 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259637  normal  0.536671 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06772  conserved hypothetical protein  30.38 
 
 		 372 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  32.58 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2806  XRE family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  30.7 
 
 		 271 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  30.93 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  25.4 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.03 
 
 		 159 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2387  XRE family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3304  signal peptide protein  33.9 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0282721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.18 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1314  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  30.12 
 
 		 476 aa  41.2  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.79469  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2831  cupin 2 domain-containing protein  35.94 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  30.14 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  22.94 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0378  cupin region  25.93 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  28.26 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3979  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  31.58 
 
 		 475 aa  40.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.754605 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0056  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  26.23 
 
 		 467 aa  40.4  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10784  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  37.25 
 
 		 472 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.218624 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>