75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3503 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 182 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.47 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.1 
 
 		 186 aa  107  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.77 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  36.64 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.83 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.83 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  30.4 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  33.07 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.15 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  30.66 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.93 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  32.17 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.81 
 
 		 160 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.66 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.69 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  27.41 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  28.69 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  29.07 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.91 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.08 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  32.5 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.12 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.98 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3608  cupin 2 domain-containing protein  25.85 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13649  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  29.23 
 
 		 145 aa  51.2  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  28.69 
 
 		 157 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 153 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3067  cupin 2 domain-containing protein  28.47 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  31.87 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.06 
 
 		 152 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.35 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  30 
 
 		 163 aa  47.8  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  47.06 
 
 		 167 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  34.38 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  27 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.91 
 
 		 136 aa  47.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2831  cupin 2 domain-containing protein  47.06 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.39 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.22 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  29.9 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  32.47 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.31 
 
 		 169 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  42 
 
 		 137 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.6 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  27.35 
 
 		 150 aa  45.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.08 
 
 		 163 aa  45.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.81 
 
 		 135 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1649  cupin 2 domain-containing protein  25.81 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1675  cupin 2, barrel  25.81 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5649  cupin 2 domain-containing protein  25.81 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1700  cupin 2 domain-containing protein  25.81 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.792463 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  28.21 
 
 		 338 aa  44.7  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0548  cupin 2 domain-containing protein  25.81 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0630  cupin 2 domain-containing protein  25.81 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  27.78 
 
 		 146 aa  44.3  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  28.42 
 
 		 148 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0535  cupin 2 domain-containing protein  25.81 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  32.76 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  28.93 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  32.5 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  34.38 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  29.06 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.12 
 
 		 154 aa  42  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1659  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.56 
 
 		 108 aa  42  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5448  cupin 2, barrel  26.37 
 
 		 147 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.708388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5845  cupin 2 domain-containing protein  26.37 
 
 		 147 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11002  dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07350)  26.26 
 
 		 355 aa  41.6  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.627949  normal  0.657367 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18490  mannose-6-phosphate isomerase  43.18 
 
 		 127 aa  41.2  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.151918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2044  hypothetical protein  31.94 
 
 		 128 aa  40.8  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.39 
 
 		 111 aa  40.8  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>