51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2778 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 111 aa  230  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5708  cupin 2 domain-containing protein  64.86 
 
 		 111 aa  165  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.56 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0445  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.75 
 
 		 123 aa  110  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.205887 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.28 
 
 		 136 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2831  cupin 2 domain-containing protein  41.12 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2044  hypothetical protein  36.47 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.45 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 		 204 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  38.71 
 
 		 311 aa  51.6  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  44.64 
 
 		 191 aa  50.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.18 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.18 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.19 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  31.11 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6135  hypothetical protein  39.06 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.715074  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.46 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.98 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471134  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  34.21 
 
 		 658 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0715  transcriptional regulator, XRE family  30.39 
 
 		 187 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2183  bicupin, oxalate decarboxylase family  33.33 
 
 		 384 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0016  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose- 6-phosphate isomerase  38.24 
 
 		 447 aa  44.3  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1447  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.72 
 
 		 190 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.428247 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  32.1 
 
 		 197 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 192 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  30.95 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  32.56 
 
 		 150 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  37.18 
 
 		 163 aa  43.5  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0200  oxalate decarboxylase  32.91 
 
 		 378 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.71 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1480  transcriptional regulator, AraC family  37.25 
 
 		 288 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0895908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.68 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  32.81 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  35.56 
 
 		 190 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  33.77 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0508  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 295 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.3342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2678  bicupin, oxalate decarboxylase family  32.53 
 
 		 418 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.87 
 
 		 166 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1036  cupin 2 domain-containing protein  28.21 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.276855  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2400  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5005  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 		 255 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  33.85 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0895  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.39 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  28 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01320  hypothetical protein  26.88 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333196  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8205  hypothetical protein  25.81 
 
 		 136 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1714  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 182 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.510937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0056  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.3 
 
 		 467 aa  40  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>