102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2471 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 113 aa  228  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  97.35 
 
 		 113 aa  222  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  58.72 
 
 		 124 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.49 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.73 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  60.75 
 
 		 115 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  46.3 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  56.38 
 
 		 117 aa  102  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  50.5 
 
 		 114 aa  102  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  49.49 
 
 		 105 aa  100  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  54.76 
 
 		 111 aa  100  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.22 
 
 		 111 aa  99.8  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  48.6 
 
 		 109 aa  97.4  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  46 
 
 		 110 aa  94.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  46.23 
 
 		 111 aa  94.4  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  40.59 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0699  hypothetical protein  40.21 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  47.37 
 
 		 137 aa  88.6  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  43.75 
 
 		 111 aa  88.6  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  39.09 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  41.05 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  40.21 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0788  cupin 2 domain-containing protein  42.27 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490865  normal  0.22734 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.1 
 
 		 111 aa  84.3  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  40.95 
 
 		 110 aa  84  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.42 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  45.35 
 
 		 87 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.59 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.24 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.24 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2016  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.11 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178864  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.24 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  41.58 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  39.6 
 
 		 106 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  35.92 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  33.93 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.76 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.67 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  36.96 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  38.55 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  34.41 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.95 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.29 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09790  cupin domain-containing protein  34.62 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778128 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.14 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3899  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  33.73 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  35.06 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  34.83 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  27.47 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1690  hypothetical protein  27.78 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0136157 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  25.89 
 
 		 122 aa  48.9  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  38.36 
 
 		 113 aa  48.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.5 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.72 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0425  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.44 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0839073  hitchhiker  0.0000787974 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.18 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5708  cupin 2 domain-containing protein  29.89 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3665  hypothetical protein  30.14 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  28.41 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  37.5 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.56 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2831  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.08 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0754  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.75 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  39.44 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19880  hypothetical protein  32.93 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0406618  hitchhiker  0.00288351 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000921  putative pectin degradation protein  33.8 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  30.43 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1675  cupin 2, barrel  42.86 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5649  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1700  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.792463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1649  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0548  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0630  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1207  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1054  cupin family protein  29.55 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1738  cupin 2, barrel  27.17 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.39391  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1457  hypothetical protein  32.39 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  33.77 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1033  hypothetical protein  25.27 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0535  cupin 2 domain-containing protein  40.82 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0439  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.65 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.5 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08490  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.08 
 
 		 105 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2287  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.76 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.709012  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0824  hypothetical protein  29.41 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.794213  normal  0.445221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.87 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0932  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1699  hypothetical protein  35.48 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275263  normal  0.0722973 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  37.21 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0275  hypothetical protein  32.58 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  37.84 
 
 		 179 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  37.14 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1190  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.85 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1659  Cupin 2 conserved barrel domain protein  21.43 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>