55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0816 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 106 aa  219  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  84.91 
 
 		 106 aa  191  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  76.42 
 
 		 106 aa  177  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.53 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.58 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.58 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  37.5 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.67 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.05 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  36.08 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  35.79 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  33 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.05 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.37 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  30 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.48 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  34.15 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.48 
 
 		 112 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  37.68 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  35.05 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  34.48 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  33.33 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  31.37 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0699  hypothetical protein  30.61 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  26.21 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  36.14 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3899  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2016  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.05 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  34.83 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  35.23 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.9 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.9 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  32.95 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  34.52 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  29.67 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.71 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  31.33 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  24.27 
 
 		 214 aa  48.5  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  30.68 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.59 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.73 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0788  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490865  normal  0.22734 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  27.91 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2287  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.17 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.709012  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  27.27 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  27.96 
 
 		 110 aa  42.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0754  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19880  hypothetical protein  30.99 
 
 		 123 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0406618  hitchhiker  0.00288351 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  30.26 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.92 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 110 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  21.18 
 
 		 112 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>