95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1603 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 87 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  71.26 
 
 		 115 aa  135  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.45 
 
 		 111 aa  110  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.19 
 
 		 113 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  54.22 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  51.81 
 
 		 111 aa  93.6  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  48.81 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.19 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.24 
 
 		 113 aa  90.5  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  51.81 
 
 		 110 aa  90.1  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  53.01 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  53.09 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  46.34 
 
 		 219 aa  87.4  5e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  51.81 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  48.19 
 
 		 214 aa  87  8e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  49.4 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  46.99 
 
 		 111 aa  86.7  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  49.4 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.58 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.6 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.15 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.6 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.6 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  49.4 
 
 		 111 aa  84  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  44.58 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  52 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.56 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  43.37 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.35 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.35 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  48.75 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  43.37 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0699  hypothetical protein  43.21 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2016  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.96 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178864  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.53 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.58 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.58 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  43.37 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  43.37 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.04 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0788  cupin 2 domain-containing protein  38.55 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490865  normal  0.22734 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09790  cupin domain-containing protein  35.29 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  32.93 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  34.15 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.93 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  32.94 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  34.94 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3899  cyclic nucleotide-binding protein  32.94 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000921  putative pectin degradation protein  37.68 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  35.62 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  28.4 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3287  cupin 2 domain-containing protein  34.72 
 
 		 107 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.927122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1690  hypothetical protein  33.8 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0136157 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 192 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  30.14 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3670  cupin 2 domain-containing protein  30.49 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183912  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  30.99 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1444  cupin 2 domain-containing protein  34.38 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  25.68 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  31.51 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2699  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.6 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145082  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7186  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.15 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1039  MerR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 192 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5186  hypothetical protein  29.49 
 
 		 312 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.41986  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  36.62 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0275  hypothetical protein  29.49 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  27.5 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  42.5 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.4 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2287  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.709012  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1317  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2365  transcriptional regulator, XRE family  34.09 
 
 		 193 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.0272358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  30.56 
 
 		 107 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4742  cupin 2 domain-containing protein  28.99 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000930389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.85 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3718  cupin 2, barrel  25.88 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  28.17 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  32.81 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.14 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2038  transcriptional regulator  28 
 
 		 230 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.547476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6741  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.65 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.43 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1110  Phosphate butyryltransferase  25.97 
 
 		 503 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3893  pectin degradation protein  33.78 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0274  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  27.63 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  28.95 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 294 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.03 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  31.08 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 234 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  28.95 
 
 		 138 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.26 
 
 		 114 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>