41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0275 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0275  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  316  7.999999999999999e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5186  hypothetical protein  97.99 
 
 		 312 aa  293  6e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.41986  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3718  cupin 2, barrel  26.21 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.47 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0932  cupin 2 domain-containing protein  30.86 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  38.46 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  35.29 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3670  cupin 2 domain-containing protein  31.76 
 
 		 111 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801583 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.59 
 
 		 111 aa  47.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.71 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.71 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4087  cupin region  32.47 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586416  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0363  hypothetical protein  24.74 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.540367  normal  0.422558 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0891  cupin 2, barrel  27.16 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.049809  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.63 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2156  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.89 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.888659  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  29.87 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  35.53 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  31.43 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.87 
 
 		 104 aa  44.3  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  30.77 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  35.53 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  37.97 
 
 		 117 aa  44.3  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 110 aa  43.9  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1707  cupin 2 protein  25.74 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0361  hypothetical protein  27.59 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642928  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  29.49 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  28.44 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5777  hypothetical protein  32.47 
 
 		 111 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  29.81 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.89 
 
 		 110 aa  42.4  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0788  cupin 2 domain-containing protein  32.11 
 
 		 111 aa  42  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490865  normal  0.22734 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  26.74 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19880  hypothetical protein  36.23 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0406618  hitchhiker  0.00288351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.58 
 
 		 113 aa  40.8  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.58 
 
 		 113 aa  40.8  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  28.74 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>