50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0897 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 110 aa  217  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  97.27 
 
 		 110 aa  212  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1304  cupin 2 domain-containing protein  59.63 
 
 		 110 aa  125  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0891  cupin 2, barrel  49.53 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.049809  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1699  hypothetical protein  48.6 
 
 		 111 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275263  normal  0.0722973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.73 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5777  hypothetical protein  49.07 
 
 		 111 aa  93.6  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  41.82 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4087  cupin region  45.37 
 
 		 113 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586416  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3718  cupin 2, barrel  42.06 
 
 		 109 aa  88.6  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0932  cupin 2 domain-containing protein  42.99 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0361  hypothetical protein  42.99 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642928  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3670  cupin 2 domain-containing protein  42.06 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801583 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1257  hypothetical protein  40 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1707  cupin 2 protein  41.12 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1894  hypothetical protein  38.18 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5520  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.12 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0403366  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  38.81 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  41.54 
 
 		 112 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  30.95 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  31.13 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  33.75 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  40 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.24 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  33.82 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1033  hypothetical protein  32.26 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1179  hypothetical protein  27.78 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4297  hypothetical protein  38.6 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  34.29 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  30.85 
 
 		 115 aa  43.5  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  33.02 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4174  hypothetical protein  32.5 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257816  normal  0.271179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0517  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0275  hypothetical protein  29.89 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  32.53 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  32.5 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 277 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5186  hypothetical protein  29.89 
 
 		 312 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.41986  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  30.19 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3698  hypothetical protein  40.3 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  30.19 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  30.19 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2382  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.56 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.82 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1814  hypothetical protein  34.33 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0210  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  25 
 
 		 113 aa  40  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>