22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1894 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1894  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  346  7e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1257  hypothetical protein  90.08 
 
 		 125 aa  218  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0932  cupin 2 domain-containing protein  43.93 
 
 		 109 aa  96.7  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1707  cupin 2 protein  42.06 
 
 		 109 aa  89  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3670  cupin 2 domain-containing protein  39.64 
 
 		 111 aa  83.6  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0891  cupin 2, barrel  39.25 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.049809  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1304  cupin 2 domain-containing protein  39.25 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3718  cupin 2, barrel  41.9 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.7 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1699  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  77  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275263  normal  0.0722973 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5777  hypothetical protein  37.38 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  33.64 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.18 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0361  hypothetical protein  36.36 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642928  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4087  cupin region  35.51 
 
 		 113 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586416  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5520  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.93 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0403366  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0517  cupin 2 domain-containing protein  32.11 
 
 		 109 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622754 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  30.39 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  29.41 
 
 		 110 aa  43.9  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.61 
 
 		 112 aa  41.2  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19880  hypothetical protein  28.75 
 
 		 123 aa  40.8  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0406618  hitchhiker  0.00288351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>