21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1257 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1257  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  250  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1894  hypothetical protein  90.08 
 
 		 170 aa  218  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0932  cupin 2 domain-containing protein  43.93 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1707  cupin 2 protein  42.06 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0891  cupin 2, barrel  40.19 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.049809  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1699  hypothetical protein  42.06 
 
 		 111 aa  84.3  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275263  normal  0.0722973 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3718  cupin 2, barrel  42.86 
 
 		 109 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5777  hypothetical protein  39.45 
 
 		 111 aa  84  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3670  cupin 2 domain-containing protein  38.74 
 
 		 111 aa  83.6  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801583 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  41.82 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1304  cupin 2 domain-containing protein  38.89 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.25 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 110 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0361  hypothetical protein  38.74 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642928  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  35.14 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4087  cupin region  36.11 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586416  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5520  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.51 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0403366  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0517  cupin 2 domain-containing protein  33.03 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622754 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  31.37 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.71 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0363  hypothetical protein  22.89 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.540367  normal  0.422558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>