16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0363 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0363  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  272  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.540367  normal  0.422558 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  27.88 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3718  cupin 2, barrel  30.77 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0891  cupin 2, barrel  26.83 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.049809  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  27.06 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0275  hypothetical protein  24.74 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5186  hypothetical protein  24.74 
 
 		 312 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.41986  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0932  cupin 2 domain-containing protein  25.93 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1304  cupin 2 domain-containing protein  27.63 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5520  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.32 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0403366  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0361  hypothetical protein  25.61 
 
 		 115 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642928  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.77 
 
 		 111 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2756  hypothetical protein  31.76 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1707  cupin 2 protein  26.44 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1257  hypothetical protein  22.89 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3670  cupin 2 domain-containing protein  24.68 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>