25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1707 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1707  cupin 2 protein  100 
 
 		 109 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0891  cupin 2, barrel  56.88 
 
 		 109 aa  127  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.049809  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0932  cupin 2 domain-containing protein  52.29 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3718  cupin 2, barrel  52.29 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5777  hypothetical protein  53.27 
 
 		 111 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3670  cupin 2 domain-containing protein  52.53 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801583 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0361  hypothetical protein  45.79 
 
 		 115 aa  103  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642928  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5520  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.15 
 
 		 111 aa  100  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0403366  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4087  cupin region  44.86 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586416  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1699  hypothetical protein  43.75 
 
 		 111 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275263  normal  0.0722973 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1257  hypothetical protein  42.06 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.93 
 
 		 111 aa  90.5  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1894  hypothetical protein  42.06 
 
 		 170 aa  89  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  38.32 
 
 		 111 aa  88.6  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1304  cupin 2 domain-containing protein  42.99 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  42.99 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.12 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0517  cupin 2 domain-containing protein  35.37 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622754 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2799  hypothetical protein  35.59 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7832900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0275  hypothetical protein  25.74 
 
 		 159 aa  43.5  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  32.26 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5186  hypothetical protein  25.74 
 
 		 312 aa  42.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.41986  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1179  hypothetical protein  24.14 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0363  hypothetical protein  26.44 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.540367  normal  0.422558 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0825  cupin 2 domain-containing protein  32.84 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>