38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0825 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0825  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 136 aa  277  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.61 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471134  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2400  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.42 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  29.55 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.46 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.31 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.96 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  29.59 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.21 
 
 		 192 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 197 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  37.37 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05332  AraC-like ligand binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14370)  29.25 
 
 		 203 aa  43.9  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1633  cupin 2 domain-containing protein  28.92 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.67 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.21 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5028  cupin 2 domain-containing protein  32.65 
 
 		 210 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2362  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.96 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  31.68 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.44 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0826  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  39.34 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  37.5 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1599  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  47.17 
 
 		 474 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.225749  normal  0.701374 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 472 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.218624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.09 
 
 		 133 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.47 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  42.65 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.16 
 
 		 172 aa  41.2  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  28.74 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.71 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  27.96 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1036  cupin 2 domain-containing protein  23.16 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.276855  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1580  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.26 
 
 		 458 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.492771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  28.46 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3572  cupin region  31.08 
 
 		 178 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0140245  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 197 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  32.65 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1707  cupin 2 protein  32.84 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>