59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2400 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2400  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 127 aa  261  2e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0895  cupin 2 domain-containing protein  61.29 
 
 		 125 aa  171  2.9999999999999996e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0819  cupin 2 domain-containing protein  41.51 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  36.59 
 
 		 123 aa  87.8  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1595  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.86 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.040843 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.03 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  28.95 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.13 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  27.78 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1633  cupin 2 domain-containing protein  31.71 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.21 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1335  cupin 2 domain-containing protein  32.93 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568302  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1351  cupin 2 domain-containing protein  32.93 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00886277  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1036  cupin 2 domain-containing protein  29.76 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.276855  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  26.79 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.38 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0456493  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2600  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.556264 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.55 
 
 		 121 aa  48.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0825  cupin 2 domain-containing protein  28.42 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1580  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  31.63 
 
 		 458 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.492771  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1386  cupin 2 domain-containing protein  20.91 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1167  cupin 2 domain-containing protein  24.21 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168838 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 179 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1613  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 299 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0246689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  26.8 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 311 aa  44.7  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2845  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose- 6-phosphate isomerase  29 
 
 		 456 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 		 182 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0468  cupin 2 domain-containing protein  25.4 
 
 		 157 aa  43.5  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.58 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471134  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.56 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0332  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.61 
 
 		 458 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.174943  hitchhiker  0.000174576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5005  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 255 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  41.82 
 
 		 285 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  33.85 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2234  cupin 2, barrel  25 
 
 		 159 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.328045 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0833  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 449 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  31.48 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1397  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  27.55 
 
 		 461 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3322  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.79 
 
 		 255 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0685  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  28.99 
 
 		 477 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3136  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.56 
 
 		 456 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.45 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2463  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.81 
 
 		 165 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0556151  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 182 aa  40.4  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.25 
 
 		 186 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  30.67 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  28.99 
 
 		 192 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  30.67 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  30.67 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.88 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1883  Cupin 2 conserved barrel domain protein  21.78 
 
 		 157 aa  40  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  28 
 
 		 182 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>