39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1351 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1351  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 114 aa  232  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00886277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1335  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 114 aa  232  1.0000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568302  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1036  cupin 2 domain-containing protein  52.34 
 
 		 104 aa  122  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.276855  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  46.09 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1633  cupin 2 domain-containing protein  47.27 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1386  cupin 2 domain-containing protein  39.13 
 
 		 116 aa  90.1  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.05 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.75 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0456493  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2600  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.73 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.556264 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.08 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.05 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1595  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.05 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.040843 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.21 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  30.69 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0819  cupin 2 domain-containing protein  31.13 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2400  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.93 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0895  cupin 2 domain-containing protein  30.85 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.44 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.38 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1043  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 181 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0468  cupin 2 domain-containing protein  28.26 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2127  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1599  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.11 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00522565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3587  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.22 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.726576  normal  0.0347651 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1243  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.72 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  27.03 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1167  cupin 2 domain-containing protein  23.16 
 
 		 152 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168838 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3343  cupin 2, barrel  33.78 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.235218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.44 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1001  hypothetical protein  31.65 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.16 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.992121 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2449  cupin 2 domain-containing protein  33.78 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.92 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.43 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.59 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 311 aa  40.4  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2000  hypothetical protein  30.26 
 
 		 156 aa  40  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>