126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0303 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 121 aa  244  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  85.95 
 
 		 121 aa  212  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2600  Cupin 2 conserved barrel domain protein  70.34 
 
 		 133 aa  174  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.556264 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.92 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  42.98 
 
 		 117 aa  103  7e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1595  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.61 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.040843 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.7 
 
 		 118 aa  84  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  38.95 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0456493  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1036  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 104 aa  67  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.276855  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1335  cupin 2 domain-containing protein  35.05 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568302  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1351  cupin 2 domain-containing protein  35.05 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00886277  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1633  cupin 2 domain-containing protein  34.83 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  32.65 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1386  cupin 2 domain-containing protein  33 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0895  cupin 2 domain-containing protein  33.68 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.78 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.67 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  33.68 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.03 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  37.18 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0819  cupin 2 domain-containing protein  32.95 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  29.27 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.95 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.59 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.93 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471134  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.59 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  42.62 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.96 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2400  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.55 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.95 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.53 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.06 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  35.23 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  35 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.84 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 199 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 182 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0812  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.62 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000379382  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1775  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.99 
 
 		 484 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.972729  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3893  pectin degradation protein  31.07 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 234 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  30.59 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8090  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.09 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.958297  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1690  hypothetical protein  34.29 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0136157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 181 aa  44.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  34.78 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  32.05 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1779  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.79 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2368  cupin 2 domain-containing protein  32.32 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.034272  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8205  hypothetical protein  33.73 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  31.4 
 
 		 149 aa  43.5  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.64 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2799  hypothetical protein  37.7 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7832900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  33.7 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0901  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  28.87 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.554615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.18 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1090  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  29.41 
 
 		 508 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.69906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  33.73 
 
 		 311 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4592  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.91 
 
 		 112 aa  42  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.73 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1561  cupin 2 domain-containing protein  34.85 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0537861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.82 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0517  cupin 2 domain-containing protein  27.5 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622754 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.26 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0056  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  31.34 
 
 		 467 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10784  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08490  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2583  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.41 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.94 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  29.9 
 
 		 182 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3695  cupin region  41.79 
 
 		 127 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.47 
 
 		 136 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5098  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.07 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0825  cupin 2 domain-containing protein  29.47 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3096  transcriptional regulator, XRE family  31.18 
 
 		 192 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00124629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.75 
 
 		 159 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.42 
 
 		 132 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0906  cupin region  30.84 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4931  transcriptional regulator, XRE family  31.11 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  42.86 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  28 
 
 		 182 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  28 
 
 		 182 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1599  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  29.73 
 
 		 474 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.225749  normal  0.701374 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2031  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.22 
 
 		 478 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0272076  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 		 182 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  28 
 
 		 182 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  36.76 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47950  Cupin, RmlC-type protein  27.84 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0826  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0834  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  32.88 
 
 		 484 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.855143  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1767  cupin 2, barrel  40.3 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0773162  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 208 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 208 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 208 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2408  cupin 2 domain-containing protein  27.62 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231406 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  32.47 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>