69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3405 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 156 aa  316  7.999999999999999e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  45.74 
 
 		 166 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5660  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.96 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.215719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  42.06 
 
 		 165 aa  99  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  36.24 
 
 		 165 aa  94.4  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  35.57 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  35.57 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  36.84 
 
 		 178 aa  92  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  38.81 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.45 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.4 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.76 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  36.45 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  34.58 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  26.67 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.4 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  32.29 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.72 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  33.08 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  29.3 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  29.75 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.37 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.93 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  25.21 
 
 		 150 aa  50.8  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.52 
 
 		 169 aa  50.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.63 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.37 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.93 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  26.12 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.09 
 
 		 184 aa  48.5  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.78 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  30.69 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.67 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  32.79 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  29.87 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  34 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1386  cupin 2 domain-containing protein  32.32 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  29.05 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.51 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  36.63 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  28.91 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3322  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.57 
 
 		 255 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  26.03 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087666  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  31.65 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  29.7 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2213  cupin 2 domain-containing protein  32.43 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.971914  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  32.18 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  33.94 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 191 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 191 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  32.74 
 
 		 163 aa  42  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  31.58 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1351  cupin 2 domain-containing protein  31.43 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00886277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1335  cupin 2 domain-containing protein  31.43 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568302  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2200  hypothetical protein  35 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.192403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.21 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  26.26 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  26.32 
 
 		 152 aa  40.8  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  27.42 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  27.91 
 
 		 119 aa  40.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  27.78 
 
 		 148 aa  40.4  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>