96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0144 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
165 aa  337  4e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  87.27 
 
 
178 aa  286  7e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  78.79 
 
 
165 aa  259  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  78.79 
 
 
165 aa  259  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  78.79 
 
 
165 aa  259  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  45.91 
 
 
166 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.26 
 
 
159 aa  135  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5660  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.71 
 
 
170 aa  122  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.215719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.06 
 
 
156 aa  98.6  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  39.32 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  38.14 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  35.43 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087666  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.38 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  31.29 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.74 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319109  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  37.04 
 
 
163 aa  63.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
135 aa  63.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  30 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505096  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 
144 aa  62.4  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  30.28 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  27.19 
 
 
150 aa  57.4  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.63 
 
 
163 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  32.26 
 
 
138 aa  54.3  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
184 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  30.61 
 
 
139 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  32.11 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  31.45 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  40.91 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.86 
 
 
166 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.7 
 
 
169 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.87 
 
 
149 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  30.51 
 
 
153 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.97 
 
 
160 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  32.67 
 
 
155 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  29.46 
 
 
148 aa  51.6  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  40.79 
 
 
114 aa  51.2  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
131 aa  50.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997303  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  35.82 
 
 
129 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 
204 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  32.63 
 
 
189 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.81 
 
 
181 aa  50.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
169 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 
204 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.48 
 
 
163 aa  48.5  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3608  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
159 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13649  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  33.75 
 
 
132 aa  48.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.67 
 
 
133 aa  48.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1493  cupin:cupin region  34.31 
 
 
155 aa  47.4  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  22.54 
 
 
145 aa  47.4  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 
191 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  31.25 
 
 
191 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3674  cupin 2 domain-containing protein  35.21 
 
 
131 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.206207  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  32.93 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.42 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.47 
 
 
123 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.1 
 
 
159 aa  45.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  41.67 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.85 
 
 
127 aa  45.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3461  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.7 
 
 
130 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430569 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  32.84 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11002  dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07350)  33.33 
 
 
355 aa  44.7  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.627949  normal  0.657367 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3867  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.11 
 
 
145 aa  44.3  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.468547  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  30.94 
 
 
163 aa  44.3  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3880  cupin 2, barrel  35.9 
 
 
163 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434972  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  31.33 
 
 
120 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30 
 
 
274 aa  43.9  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2810  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.71 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.597474  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  32.63 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.95 
 
 
126 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3067  cupin 2 domain-containing protein  27.05 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  32.31 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  33 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  31.46 
 
 
122 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04560  expressed protein  25.85 
 
 
177 aa  43.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  32.31 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  32.31 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  32.31 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4829  cupin 2 domain-containing protein  38.71 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0191257  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  32.31 
 
 
120 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.09 
 
 
115 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  32.31 
 
 
120 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0666056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  32.31 
 
 
120 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  32.31 
 
 
120 aa  42.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5028  cupin 2 domain-containing protein  32.11 
 
 
210 aa  42.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.15 
 
 
130 aa  42  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.51 
 
 
377 aa  41.6  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  33.85 
 
 
117 aa  41.6  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0937  hypothetical protein  36 
 
 
170 aa  41.2  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  29.29 
 
 
163 aa  41.2  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  31.91 
 
 
338 aa  41.2  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0464  mannose-6-phosphate isomerase type II  33.78 
 
 
128 aa  41.2  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0832  cupin 2 domain-containing protein  36.49 
 
 
139 aa  40.8  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2368  cupin 2 domain-containing protein  34.15 
 
 
137 aa  40.8  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.034272  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  30.77 
 
 
120 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>