74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2609 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 160 aa  324  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 181 aa  73.9  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  31.5 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.78 
 
 		 204 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.49 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.78 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.64 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  30.97 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  35.4 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  33.63 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.66 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.04 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.81 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.17 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.93 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.18 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  33.64 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  31.01 
 
 		 191 aa  53.9  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.67 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  30.09 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  29.61 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.04 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  33.77 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  32.08 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.17 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  27.21 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  27.93 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  30.84 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  32.06 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  29 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.67 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  29 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  29 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.72 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.38 
 
 		 118 aa  48.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  29.91 
 
 		 169 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  29.41 
 
 		 166 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5845  cupin 2 domain-containing protein  29.52 
 
 		 147 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5448  cupin 2, barrel  29.52 
 
 		 147 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.708388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  28.42 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  28.97 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5028  cupin 2 domain-containing protein  27.88 
 
 		 210 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5084  cupin superfamily protein  30.95 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259637  normal  0.536671 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  35.87 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.06 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.35 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2810  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.86 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.597474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 134 aa  44.3  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3608  cupin 2 domain-containing protein  29.7 
 
 		 159 aa  43.9  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  37.25 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1355  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.646374  normal  0.0330672 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2831  cupin 2 domain-containing protein  41.67 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.02 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2213  cupin 2 domain-containing protein  31.3 
 
 		 125 aa  42.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.971914  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  27.62 
 
 		 129 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3067  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.16 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  36.07 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0535  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 147 aa  42  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1700  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.792463 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1675  cupin 2, barrel  26.67 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5649  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1649  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0548  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0630  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1447  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.23 
 
 		 190 aa  41.2  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.428247 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 188 aa  41.2  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  30.26 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>