35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1355 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1355  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 195 aa  394  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.646374  normal  0.0330672 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  32.2 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.46 
 
 		 160 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  30.16 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.47 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.06 
 
 		 163 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  35.92 
 
 		 163 aa  52.4  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  30.39 
 
 		 157 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.43 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.43 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  29.46 
 
 		 152 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  36.23 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  28.8 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 165 aa  49.7  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  29 
 
 		 171 aa  48.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.54 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.93 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.4 
 
 		 169 aa  45.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  32.18 
 
 		 174 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  28.44 
 
 		 153 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.33 
 
 		 149 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  33.68 
 
 		 139 aa  45.1  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.38 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  40.91 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  29.17 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33 
 
 		 160 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 135 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.58 
 
 		 152 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.67 
 
 		 159 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  32.47 
 
 		 158 aa  42  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.47 
 
 		 169 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 149 aa  41.6  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>