104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3706 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 163 aa  328  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  46.58 
 
 		 179 aa  130  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.27 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  42.39 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.31 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  43.16 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.64 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  35.54 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.54 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.54 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.93 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.4 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.34 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.04 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  31.65 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.97 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  36.17 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.65 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  27.19 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1355  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 195 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.646374  normal  0.0330672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  30.89 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0737  cupin 2 domain-containing protein  29.41 
 
 		 207 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.21 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  38.82 
 
 		 197 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 135 aa  52.4  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.14 
 
 		 152 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.68 
 
 		 186 aa  51.2  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  36.46 
 
 		 171 aa  50.8  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  29.55 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5929  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.93 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  32.98 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  32.41 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  32.41 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  32.41 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1633  cupin 2 domain-containing protein  31.91 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  32.26 
 
 		 123 aa  49.7  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  33.02 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.65 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.16 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 184 aa  48.5  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.23 
 
 		 166 aa  48.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  31.48 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  31.91 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  27.78 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  29.36 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3608  cupin 2 domain-containing protein  38.14 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2586  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.26 
 
 		 126 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000628471  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  30.25 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  31.13 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.7 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.67 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.65 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  30.11 
 
 		 189 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 		 197 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  27.59 
 
 		 139 aa  45.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 153 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  31.18 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  34.19 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  31.18 
 
 		 138 aa  44.7  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  27.14 
 
 		 141 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  30.25 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  28.69 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  30.25 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1927  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.94 
 
 		 477 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal  0.35544 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  30.25 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.9 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.17 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  32.58 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.39 
 
 		 133 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1043  cupin 2 domain-containing protein  29.7 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  29.51 
 
 		 108 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0825  cupin 2 domain-containing protein  30.21 
 
 		 136 aa  43.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  28.46 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4857  cupin domain-containing protein  26.53 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0286871 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  29.31 
 
 		 129 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4609  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 229 aa  42.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  29.51 
 
 		 114 aa  42.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.22 
 
 		 160 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  33.87 
 
 		 172 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4829  cupin 2 domain-containing protein  28.44 
 
 		 182 aa  42.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0191257  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  27.55 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  27.55 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0580  hypothetical protein  27.97 
 
 		 160 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  34.67 
 
 		 338 aa  41.6  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2004  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.7 
 
 		 141 aa  41.6  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 181 aa  41.2  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  27.97 
 
 		 160 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  28.81 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.8 
 
 		 145 aa  41.2  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1711  hypothetical protein  35 
 
 		 126 aa  40.8  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0711827  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0760  cupin domain-containing protein  35 
 
 		 126 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0558257  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2435  cupin domain-containing protein  35 
 
 		 126 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2296  cupin domain-containing protein  35 
 
 		 126 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.686481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>