57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2309 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  286  7e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  64.71 
 
 		 138 aa  191  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  47.41 
 
 		 135 aa  140  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.45 
 
 		 135 aa  136  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  38.61 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.7 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.39 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  29.03 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.08 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  32.65 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  32.65 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  31.3 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  32.65 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  38.18 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  30.61 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  32.14 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  28.16 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  30.61 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.65 
 
 		 184 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.97 
 
 		 192 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.72 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.63 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  26.5 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.76 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  28.57 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.93 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2831  cupin 2 domain-containing protein  31.87 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  27.03 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087666  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  27.93 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.72 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.59 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1355  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.68 
 
 		 195 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.646374  normal  0.0330672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  30.95 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.72 
 
 		 204 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.72 
 
 		 204 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.28 
 
 		 377 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  39.29 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2538  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.34 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0103935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  31.43 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5660  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 170 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.215719 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 149 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  27.59 
 
 		 169 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5084  cupin superfamily protein  42.86 
 
 		 147 aa  41.2  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259637  normal  0.536671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  25.51 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  27.68 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0378  cupin region  39.58 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 181 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.72 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.11 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.61 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 189 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>