73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6634 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 189 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  40 
 
 		 163 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.64 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  34.51 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.3 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  35.29 
 
 		 163 aa  67.4  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.33 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.96 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  31.97 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.67 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1355  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.2 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.646374  normal  0.0330672 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.54 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  35.43 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 145 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.08 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  28.76 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.92 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.73 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  31.86 
 
 		 153 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  31.74 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  32.77 
 
 		 166 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.93 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 		 165 aa  52.4  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.93 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  34.48 
 
 		 158 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.49 
 
 		 160 aa  51.2  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.85 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.63 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  31.71 
 
 		 155 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.31 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.67 
 
 		 135 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  32.63 
 
 		 165 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  28.85 
 
 		 135 aa  49.3  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  37.7 
 
 		 182 aa  48.9  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  31 
 
 		 163 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  26.83 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2288  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.78 
 
 		 129 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.33 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0105  DNA-binding protein  32.35 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.97 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  32.79 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  32.79 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.11 
 
 		 163 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  27.12 
 
 		 138 aa  45.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 182 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  21.05 
 
 		 149 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.62 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2586  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.05 
 
 		 126 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000628471  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.21 
 
 		 160 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69980  putative transcriptional regulator  37.7 
 
 		 182 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  26.17 
 
 		 157 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3608  cupin 2 domain-containing protein  32.61 
 
 		 159 aa  41.6  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47950  Cupin, RmlC-type protein  36.84 
 
 		 182 aa  41.2  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6075  putative transcriptional regulator  37.7 
 
 		 182 aa  41.6  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 182 aa  41.6  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 195 aa  41.2  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>