111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1228 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  54.96 
 
 
138 aa  145  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  58.93 
 
 
135 aa  140  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  53.45 
 
 
139 aa  136  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  44.57 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.07 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  41.11 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  38.21 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.48 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  38.14 
 
 
190 aa  67  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  45 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
178 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.14 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.47 
 
 
145 aa  61.6  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.03 
 
 
169 aa  60.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.79 
 
 
192 aa  60.1  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  33.04 
 
 
165 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  33.04 
 
 
165 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  32.82 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  35.42 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  31.71 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505096  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.54 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.59 
 
 
159 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  37.72 
 
 
163 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  33.04 
 
 
165 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.93 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  39.08 
 
 
169 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.81 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  34.23 
 
 
179 aa  53.9  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  34.51 
 
 
171 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  35.42 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  29.82 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087666  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  33.93 
 
 
163 aa  51.6  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.12 
 
 
184 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0378  cupin region  45.76 
 
 
153 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930622  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.63 
 
 
156 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.51 
 
 
377 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  31.67 
 
 
189 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.87 
 
 
389 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0737  cupin 2 domain-containing protein  39.71 
 
 
207 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.58 
 
 
181 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.64 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.4 
 
 
172 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319109  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.07 
 
 
204 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.32 
 
 
204 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  24.56 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  44.9 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.39 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0506  hypothetical protein  36.9 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0871689  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  36.67 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2831  cupin 2 domain-containing protein  29.03 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5660  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.78 
 
 
170 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.215719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.03 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.81 
 
 
182 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5084  cupin superfamily protein  44.07 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259637  normal  0.536671 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4592  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.44 
 
 
112 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5028  cupin 2 domain-containing protein  29.2 
 
 
210 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 
152 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  37.1 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.43 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1355  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 
195 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.646374  normal  0.0330672 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.56 
 
 
274 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0440  cupin 2, barrel  24.56 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351298  normal  0.537185 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.75 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.59 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0589  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.07 
 
 
162 aa  42  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0993082  normal  0.853909 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.8 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.61 
 
 
191 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.78 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.73 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  34.43 
 
 
114 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  38 
 
 
138 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  39.47 
 
 
332 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3856  cupin 2, barrel  34.85 
 
 
123 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.875667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1675  cupin 2, barrel  34.88 
 
 
147 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5448  cupin 2, barrel  35.82 
 
 
147 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.708388  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5649  cupin 2 domain-containing protein  34.88 
 
 
147 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5845  cupin 2 domain-containing protein  35.82 
 
 
147 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1700  cupin 2 domain-containing protein  34.88 
 
 
147 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.792463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0535  cupin 2 domain-containing protein  34.88 
 
 
147 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1649  cupin 2 domain-containing protein  34.88 
 
 
147 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316822  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0548  cupin 2 domain-containing protein  34.88 
 
 
147 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915131  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0630  cupin 2 domain-containing protein  34.88 
 
 
147 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 
149 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 
152 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1599  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.56 
 
 
108 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00522565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1447  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 
190 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.428247 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.33 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  38.89 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.33 
 
 
128 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  28.44 
 
 
191 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  30.43 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4683  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.1 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  9.43245e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 
158 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.33 
 
 
172 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  35.71 
 
 
152 aa  40.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  30.58 
 
 
163 aa  40.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>