93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3791 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 159 aa  327  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.53 
 
 		 192 aa  77.4  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.29 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  38.53 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  32 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  39.08 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.38 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  37 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  30.11 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  34.48 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.37 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  27.74 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  34.07 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  34.31 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3608  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.12 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.78 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.36 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.28 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.97 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  32.67 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  28.89 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  28.45 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0454  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.82 
 
 		 356 aa  54.3  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.62 
 
 		 204 aa  53.9  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.62 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  32.67 
 
 		 174 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.17 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.66 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  31.75 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 135 aa  52  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.72 
 
 		 186 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.04 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3067  cupin 2 domain-containing protein  29.17 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5448  cupin 2, barrel  29.81 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.708388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5845  cupin 2 domain-containing protein  29.81 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11002  dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07350)  27.72 
 
 		 355 aa  49.3  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.627949  normal  0.657367 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.67 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1700  cupin 2 domain-containing protein  28.18 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.792463 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1675  cupin 2, barrel  28.18 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1649  cupin 2 domain-containing protein  28.18 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.23 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  31.18 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0548  cupin 2 domain-containing protein  28.18 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  27.27 
 
 		 338 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5649  cupin 2 domain-containing protein  28.18 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0630  cupin 2 domain-containing protein  28.18 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0056  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  28.89 
 
 		 467 aa  48.5  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10784  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.85 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.96 
 
 		 294 aa  47  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  29.55 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0535  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.39 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2200  hypothetical protein  36.89 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.192403 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  26.02 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.3 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  32.2 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  26.02 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  26.02 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  24.76 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  27.1 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.92 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  26.26 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  33.72 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  29.46 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.75 
 
 		 377 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  31.87 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  26.36 
 
 		 117 aa  44.7  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  28.72 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  29.67 
 
 		 123 aa  43.9  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  26.88 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  35.71 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.61 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  27.06 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.14 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1043  cupin 2 domain-containing protein  25.19 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.75 
 
 		 121 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 389 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0483  cupin 2 domain-containing protein  31.17 
 
 		 111 aa  41.6  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44 
 
 		 121 aa  41.6  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  35.71 
 
 		 155 aa  41.2  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  24.53 
 
 		 150 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3867  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.29 
 
 		 145 aa  40.8  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.468547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 146 aa  40.4  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>