19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5971 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 130 aa  254  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4632  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.66 
 
 		 123 aa  136  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0666075 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5098  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.93 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2240  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  33.87 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130311  normal  0.0267337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.89 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8205  hypothetical protein  33.7 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.66 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 159 aa  43.5  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0912  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  31.53 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1915  cupin 2 domain-containing protein  34.48 
 
 		 129 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  28.57 
 
 		 356 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  45.45 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3702  cupin 2 domain-containing protein  32.53 
 
 		 345 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 361 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.43 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0079  hypothetical protein  34.94 
 
 		 282 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  31.52 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.56 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>