78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1628 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  96.91 
 
 		 361 aa  715    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  98.03 
 
 		 361 aa  724    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  99.72 
 
 		 361 aa  735    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  96.63 
 
 		 361 aa  712    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  100 
 
 		 356 aa  736    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  98 
 
 		 255 aa  508  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  51.25 
 
 		 370 aa  364  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.65 
 
 		 350 aa  249  4e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.24 
 
 		 364 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5250  cupin 2 domain-containing protein  39.27 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.665578 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.06 
 
 		 374 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0679  cupin 2 domain-containing protein  85.37 
 
 		 134 aa  216  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4526  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  39.94 
 
 		 348 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000670904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2627  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  39.94 
 
 		 348 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000696095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0819  gentisate 1,2-dioxygenase  37.88 
 
 		 376 aa  206  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1825  putative dioxygenase oxidoreductase protein  37.05 
 
 		 379 aa  204  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.113884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3243  gentisate 1,2-dioxygenase  36.13 
 
 		 368 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.39318 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1387  cupin 2, barrel  37.85 
 
 		 379 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0146  gentisate 1,2-dioxygenase  38.27 
 
 		 370 aa  199  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765211 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 370 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4214  cupin 2 domain-containing protein  36.49 
 
 		 387 aa  199  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.358042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  39.23 
 
 		 345 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  39.23 
 
 		 345 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  39.23 
 
 		 345 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  39.23 
 
 		 345 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  39.23 
 
 		 345 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  35.14 
 
 		 345 aa  196  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  34.97 
 
 		 342 aa  196  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32690  gentisate 1,2-dioxygenase  39.09 
 
 		 353 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000796263  hitchhiker  0.0000100367 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4442  gentisate 1,2-dioxygenase  39.2 
 
 		 348 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.772688 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  34.97 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1087  gentisate 1,2-dioxygenase oxidoreductase protein  38.85 
 
 		 348 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3374  gentisate 1,2-dioxygenase  36.81 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203414  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1889  gentisate 1,2-dioxygenase  37.12 
 
 		 347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.319264 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  33.04 
 
 		 370 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5802  gentisate 1,2-dioxygenase  37.14 
 
 		 364 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  36.93 
 
 		 353 aa  189  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5864  gentisate 1,2-dioxygenase  37.91 
 
 		 348 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0655  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.81 
 
 		 377 aa  186  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4221  gentisate 1,2-dioxygenase  35.89 
 
 		 347 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4145  gentisate 1,2-dioxygenase  35.89 
 
 		 347 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121974  normal  0.0473391 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3059  gentisate 1,2-dioxygenase  37.57 
 
 		 349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0227445 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  35.53 
 
 		 348 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2125  gentisate 1,2-dioxygenase  32.86 
 
 		 364 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0353  gentisate 1,2-dioxygenase  36.31 
 
 		 362 aa  175  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0799  gentisate 1,2-dioxygenase  37.09 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  34.08 
 
 		 353 aa  165  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0167  cupin 2 domain-containing protein  33.52 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5102  gentisate 1,2-dioxygenase  35.31 
 
 		 283 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.562854 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0280  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.56 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3565  cupin 2, barrel  32.41 
 
 		 367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2052  cupin 2 domain-containing protein  32.56 
 
 		 377 aa  153  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3702  cupin 2 domain-containing protein  33.44 
 
 		 345 aa  152  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20700  gentisate 1,2-dioxygenase  32.38 
 
 		 372 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280371  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55211  predicted protein  33.23 
 
 		 331 aa  150  4e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.110005 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2910  cupin 2 protein  30.66 
 
 		 357 aa  145  9e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305706  normal  0.232695 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3670  cupin 2 domain-containing protein  32.26 
 
 		 351 aa  145  9e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4624  cupin 2 domain-containing protein  32.3 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57210  hypothetical protein  32.19 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3276  cupin 2, barrel  30.1 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525696  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2675  cupin 2 domain-containing protein  29.77 
 
 		 343 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2476  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3145  cupin 2 domain-containing protein  30.62 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0738  cupin 2 domain-containing protein  29.84 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2454  cupin 2 domain-containing protein  29.87 
 
 		 351 aa  126  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  32.12 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 		 181 aa  64.7  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3086  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  24.5 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.407832  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2861  hypothetical protein  30.77 
 
 		 159 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4263  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  24.69 
 
 		 366 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4258  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  29.33 
 
 		 368 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87042 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0334  hypothetical protein  26.09 
 
 		 318 aa  50.1  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66391  normal  0.0124994 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2347  hypothetical protein  29.38 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.51 
 
 		 104 aa  46.6  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  31.51 
 
 		 108 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2750  hypothetical protein  29.49 
 
 		 130 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226239  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  32.14 
 
 		 151 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2965  hypothetical protein  25.25 
 
 		 130 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0208057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>