167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2932 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
121 aa  247  5e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  82.88 
 
 
113 aa  199  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.46 
 
 
111 aa  142  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.05 
 
 
112 aa  124  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4592  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.29 
 
 
112 aa  102  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.74 
 
 
113 aa  90.1  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  41.58 
 
 
111 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2583  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  39.22 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0826  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.58 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.78 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.22 
 
 
115 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  36.96 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1659  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.73 
 
 
108 aa  60.5  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  37.78 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  35.56 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0833  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 
117 aa  60.1  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64172  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1368  hypothetical protein  35.8 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.505892  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.72 
 
 
112 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3664  hypothetical protein  39.36 
 
 
235 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
125 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  30.85 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  34.41 
 
 
100 aa  55.5  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3893  pectin degradation protein  31.58 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.38 
 
 
107 aa  54.7  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00344723  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  30.33 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 
115 aa  54.3  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  37.36 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7186  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.97 
 
 
109 aa  53.9  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0542  cupin 2, barrel  30.11 
 
 
122 aa  53.5  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
292 aa  51.6  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3670  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 
107 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183912  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2699  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.74 
 
 
113 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145082  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 
107 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8499800000000002e-33 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2135  cupin 2 domain-containing protein  32.97 
 
 
100 aa  50.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.769565  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2538  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.87 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0103935  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  35.96 
 
 
169 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0483  hypothetical protein  32.97 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.654168  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3720  XRE family transcriptional regulator  31.91 
 
 
200 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.310668  normal  0.0265405 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  35.96 
 
 
137 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4807  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 
185 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.42 
 
 
113 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2408  cupin 2 domain-containing protein  31.87 
 
 
100 aa  50.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.231406 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3464  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 
185 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4279  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 
185 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4902  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 
185 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.634753 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  34.83 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.1 
 
 
421 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5384  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 
185 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  normal  0.424249 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  39.76 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  35.63 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.71 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.5 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.59 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.5 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.69 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  38.55 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6741  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.71 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  31.87 
 
 
106 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1190  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.51 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0257  cupin 2 domain-containing protein  27.37 
 
 
130 aa  47  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 
182 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
121 aa  47.4  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0803  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 
185 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  36.14 
 
 
152 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  35.44 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0274  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  31.87 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4192  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  28.43 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  30.77 
 
 
271 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.94 
 
 
121 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  32.14 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4297  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0638  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 
184 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2042  transcriptional regulator  30.77 
 
 
188 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.47 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.66 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.208422  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.1 
 
 
110 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258222  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 
234 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5005  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.47 
 
 
255 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1779  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.67 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 
269 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.19 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0361  XRE family transcriptional regulator  30.23 
 
 
205 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000921  putative pectin degradation protein  27 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4274  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.41 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
276 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1077  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 
186 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1457  hypothetical protein  33.78 
 
 
106 aa  43.5  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1696  cupin domain-containing protein  25 
 
 
110 aa  43.5  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0819  cupin 2 domain-containing protein  29.49 
 
 
123 aa  43.5  0.0009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1805  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 
110 aa  43.5  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241802  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3695  cupin region  29.33 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.4 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0895835 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>