74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0819 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0819  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
123 aa  256  5.0000000000000005e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  48.11 
 
 
123 aa  105  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0895  cupin 2 domain-containing protein  42.28 
 
 
125 aa  98.6  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2400  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.51 
 
 
127 aa  92.4  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.95 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1633  cupin 2 domain-containing protein  36.47 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  39.53 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1036  cupin 2 domain-containing protein  33.72 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.276855  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1595  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.64 
 
 
123 aa  57.8  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.040843 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1335  cupin 2 domain-containing protein  31.13 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568302  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1351  cupin 2 domain-containing protein  31.13 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00886277  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1167  cupin 2 domain-containing protein  26.05 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.168838 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  25.23 
 
 
115 aa  54.3  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.95 
 
 
121 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  26.53 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.53 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1386  cupin 2 domain-containing protein  22.52 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.86 
 
 
118 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1373  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  28.42 
 
 
551 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1883  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.4 
 
 
157 aa  50.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 
311 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0468  cupin 2 domain-containing protein  28.43 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.47 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0456493  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  23.76 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  30 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3226  hypothetical protein  31.71 
 
 
167 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1044  methionine--tRNA ligase  36.51 
 
 
671 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0909  hypothetical protein  34.09 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0993672  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.42 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  25.33 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  32.86 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.48 
 
 
122 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5608  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.14 
 
 
469 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4503  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  34.52 
 
 
469 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.930228  normal  0.622419 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4617  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  34.52 
 
 
469 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0274196  normal  0.929739 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4135  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  34.52 
 
 
469 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.500124  normal  0.71949 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.49 
 
 
121 aa  43.5  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2202  hypothetical protein  29.29 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4014  oxalate decarboxylase  35.38 
 
 
418 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4588  oxalate decarboxylase  33.85 
 
 
418 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576029  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6318  Methionine--tRNA ligase  32.26 
 
 
662 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0056  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.56 
 
 
467 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10784  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4476  oxalate decarboxylase  35.38 
 
 
418 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.867974 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5717  oxalate decarboxylase  33.85 
 
 
418 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.130758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1256  glucose-6-phosphate isomerase and related metalloenzyme  33.85 
 
 
418 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1589  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.21 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.908983 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5708  cupin 2 domain-containing protein  29.11 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203885  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3780  twin-arginine translocation pathway signal  33.85 
 
 
418 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150369  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4894  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.2 
 
 
177 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  37.29 
 
 
250 aa  41.6  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  27.88 
 
 
148 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1202  cupin 2, barrel  29.58 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4843  cupin 2 domain-containing protein  26.55 
 
 
182 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45501  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2183  cupin 2, barrel  27.5 
 
 
166 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0487258  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2481  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 
279 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0594391  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3738  cupin 2 domain-containing protein  32.73 
 
 
281 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.250553  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4895  cupin 2 domain-containing protein  30.39 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.664893 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3273  methionyl-tRNA synthetase  31.75 
 
 
662 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2000  hypothetical protein  26.51 
 
 
156 aa  40.4  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0826  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.99 
 
 
115 aa  40.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88029  predicted protein  31.2 
 
 
741 aa  40.8  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0692998 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 
192 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.32 
 
 
180 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.861025  normal  0.798178 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1173  cupin 2 domain-containing protein  28.32 
 
 
180 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0388903  normal  0.0358477 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2575  cupin family protein  32.31 
 
 
418 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0231  oxalate decarboxylase  32.31 
 
 
418 aa  40  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.842819  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0503  oxalate decarboxylase  32.31 
 
 
418 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1413  oxalate decarboxylase  32.31 
 
 
418 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00642683  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1426  cupin family protein  32.31 
 
 
418 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1259  cupin family protein  32.31 
 
 
418 aa  40  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0758699  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.39 
 
 
107 aa  40  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1067  oxalate decarboxylase  32.31 
 
 
418 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209096  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1331  oxalate decarboxylase  32.31 
 
 
418 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>