44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5717 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5717  oxalate decarboxylase  100 
 
 		 418 aa  858    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.130758 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4476  oxalate decarboxylase  93.54 
 
 		 418 aa  771    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.867974 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1067  oxalate decarboxylase  89.21 
 
 		 418 aa  738    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209096  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1331  oxalate decarboxylase  89.21 
 
 		 418 aa  738    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1259  cupin family protein  89.21 
 
 		 418 aa  738    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0758699  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2575  cupin family protein  89.21 
 
 		 418 aa  738    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1256  glucose-6-phosphate isomerase and related metalloenzyme  96.17 
 
 		 418 aa  809    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1413  oxalate decarboxylase  89.21 
 
 		 418 aa  738    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00642683  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0503  oxalate decarboxylase  89.21 
 
 		 418 aa  738    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1426  cupin family protein  89.93 
 
 		 418 aa  744    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0231  oxalate decarboxylase  89.21 
 
 		 418 aa  738    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.842819  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3780  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 418 aa  858    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150369  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4014  oxalate decarboxylase  93.78 
 
 		 418 aa  797    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4588  oxalate decarboxylase  100 
 
 		 418 aa  858    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2678  bicupin, oxalate decarboxylase family  61.58 
 
 		 418 aa  550  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1525  oxalate decarboxylase  53.68 
 
 		 408 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264195 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1062  oxalate decarboxylase OxdD  52.6 
 
 		 398 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000538183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4237  oxalate decarboxylase OxdD  52.05 
 
 		 398 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000976291  hitchhiker  0.0000000132545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0371  bicupin, oxalate decarboxylase family  47.73 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0985  oxalate decarboxylase  47.96 
 
 		 405 aa  375  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0402  bicupin, oxalate decarboxylase family  50.66 
 
 		 404 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0110  bicupin, oxalate decarboxylase family  48.25 
 
 		 402 aa  349  6e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2183  bicupin, oxalate decarboxylase family  45.97 
 
 		 384 aa  333  4e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0200  oxalate decarboxylase  46.11 
 
 		 378 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  46.07 
 
 		 658 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08099  oxalate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14610)  40.31 
 
 		 477 aa  292  7e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal  0.0552946 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2322  oxalate decarboxylase  43.45 
 
 		 389 aa  279  8e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03563  conserved hypothetical protein  41.91 
 
 		 407 aa  261  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.86517  normal  0.801175 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2388  oxalate decarboxylase  35.09 
 
 		 389 aa  228  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510235 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0722  bicupin, oxalate decarboxylase family  48.56 
 
 		 234 aa  206  9e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1922  cupin 2 domain-containing protein  26.98 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4437  cupin domain-containing protein  28.46 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2283  Cupin domain protein  22.94 
 
 		 345 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000254412  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1577  hypothetical protein  27.52 
 
 		 224 aa  51.2  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000455455  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1792  hypothetical protein  27.52 
 
 		 211 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 146 aa  50.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  34.55 
 
 		 150 aa  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1873  hypothetical protein  30.19 
 
 		 211 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1617  cupin domain-containing protein  30.19 
 
 		 211 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1742  hypothetical protein  30.19 
 
 		 211 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.614023  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1568  hypothetical protein  30.19 
 
 		 211 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1616  hypothetical protein  30.19 
 
 		 211 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.751864  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1819  hypothetical protein  30.19 
 
 		 211 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  25.45 
 
 		 372 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898845 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>