67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1371 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 372 aa  764    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  37.27 
 
 		 166 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  36 
 
 		 167 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  34 
 
 		 167 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  31.4 
 
 		 152 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  36.09 
 
 		 172 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  33.9 
 
 		 162 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  30.6 
 
 		 172 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  36.07 
 
 		 163 aa  68.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.48 
 
 		 167 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3626  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.13 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 172 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.33 
 
 		 154 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0568  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 		 172 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  27.45 
 
 		 171 aa  57  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1917  hypothetical protein  31.2 
 
 		 172 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  25.64 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0602591  normal  0.755419 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.88 
 
 		 140 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.93 
 
 		 158 aa  53.9  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  26.85 
 
 		 152 aa  53.9  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1458  cupin 2 domain-containing protein  30.08 
 
 		 174 aa  53.5  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  24.05 
 
 		 154 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 		 159 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 		 159 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  32.41 
 
 		 171 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.35 
 
 		 172 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0814  cupin 2 protein  30.3 
 
 		 173 aa  51.2  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  43.75 
 
 		 333 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.47 
 
 		 115 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.35 
 
 		 172 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3249  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 166 aa  50.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.92 
 
 		 158 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  28.26 
 
 		 159 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5493  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.16 
 
 		 160 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.95 
 
 		 158 aa  48.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1110  cupin 2, barrel  24 
 
 		 170 aa  47  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  37.88 
 
 		 115 aa  45.4  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4588  oxalate decarboxylase  25.45 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5717  oxalate decarboxylase  25.45 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.130758 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3780  twin-arginine translocation pathway signal  25.45 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150369  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2134  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  38.36 
 
 		 464 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000409972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17330  cupin domain-containing protein  36.36 
 
 		 148 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017863  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  25 
 
 		 161 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  25 
 
 		 161 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  39.39 
 
 		 115 aa  45.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25 
 
 		 161 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25 
 
 		 161 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  37.66 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0330  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  31.63 
 
 		 491 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00801876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  30.93 
 
 		 190 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.56 
 
 		 166 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0548  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  31.63 
 
 		 480 aa  44.3  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.753424  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  31.11 
 
 		 157 aa  44.3  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2661  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.26 
 
 		 122 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.76 
 
 		 141 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4703  cupin 2 domain-containing protein  27.93 
 
 		 154 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.835831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 		 172 aa  43.5  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.36 
 
 		 156 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  27.94 
 
 		 108 aa  43.9  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  32.29 
 
 		 179 aa  43.5  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44 
 
 		 192 aa  43.5  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 332 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2150  cupin 2 domain-containing protein  29.52 
 
 		 124 aa  43.1  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1358  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 119 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.660301  normal  0.0940885 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.23 
 
 		 104 aa  42.7  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2020  cupin 2, barrel  33.72 
 
 		 155 aa  42.7  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>