274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3988 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 146 aa  292  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4993  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.06 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5854  cupin 2 domain-containing protein  46.32 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.154077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  43.8 
 
 		 135 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  42.53 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  33.94 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.95 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.08 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.1 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  31.91 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  36.25 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.56 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.36 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.58 
 
 		 421 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.03 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2685  cupin 2 domain-containing protein  38.14 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477579  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  31.93 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3867  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.71 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.468547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  30.53 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  30.85 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3175  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.48 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0737  cupin 2 domain-containing protein  30.16 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  31.91 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2852  cupin 2  31.31 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08099  oxalate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14610)  34.04 
 
 		 477 aa  53.9  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal  0.0552946 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3304  signal peptide protein  33.72 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0282721  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07738  hypothetical protein  31.73 
 
 		 173 aa  52.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 135 aa  52.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3499  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.11 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.163476 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  35.9 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  38.1 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  33.73 
 
 		 658 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04560  expressed protein  46.3 
 
 		 177 aa  52  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2799  hypothetical protein  39.71 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7832900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.25 
 
 		 192 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0200  oxalate decarboxylase  34.15 
 
 		 378 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  25.53 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0722  bicupin, oxalate decarboxylase family  30.53 
 
 		 234 aa  50.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0402  bicupin, oxalate decarboxylase family  36.59 
 
 		 404 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0371  bicupin, oxalate decarboxylase family  36.59 
 
 		 404 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0985  oxalate decarboxylase  29.47 
 
 		 405 aa  50.8  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5717  oxalate decarboxylase  33.33 
 
 		 418 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.130758 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1259  cupin family protein  32.05 
 
 		 418 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0758699  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2575  cupin family protein  32.05 
 
 		 418 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3780  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 418 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4588  oxalate decarboxylase  33.33 
 
 		 418 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0231  oxalate decarboxylase  32.05 
 
 		 418 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.842819  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0503  oxalate decarboxylase  32.05 
 
 		 418 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1413  oxalate decarboxylase  32.05 
 
 		 418 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00642683  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1331  oxalate decarboxylase  32.05 
 
 		 418 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1067  oxalate decarboxylase  32.05 
 
 		 418 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209096  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2053  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.68 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.34 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4476  oxalate decarboxylase  33.33 
 
 		 418 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.867974 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4014  oxalate decarboxylase  33.33 
 
 		 418 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1062  oxalate decarboxylase OxdD  35.44 
 
 		 398 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000538183  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  27.93 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2605  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.86 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0523242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  36.62 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1285  cupin region  33.33 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1426  cupin family protein  30.77 
 
 		 418 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4237  oxalate decarboxylase OxdD  35.44 
 
 		 398 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000976291  hitchhiker  0.0000000132545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3512  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.86 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  33 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1525  oxalate decarboxylase  36.59 
 
 		 408 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264195 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  28.83 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.47 
 
 		 132 aa  48.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  34.25 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.64 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  34.25 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1439  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 199 aa  48.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.83171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2392  cupin 2 domain-containing protein  28.7 
 
 		 140 aa  47.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  36.62 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.93 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003224  mannose-6-phosphate isomerase  29.67 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.57 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  33.75 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1256  glucose-6-phosphate isomerase and related metalloenzyme  30.77 
 
 		 418 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2328  cupin region  30.59 
 
 		 167 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal  0.388933 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2044  hypothetical protein  32.99 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.88 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2183  bicupin, oxalate decarboxylase family  31.71 
 
 		 384 aa  47.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  28.38 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1115  cupin 2 domain-containing protein  32.26 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.378995 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 171 aa  47  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.93 
 
 		 159 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0147  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.3 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  29.35 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1358  cupin 2 domain-containing protein  35.62 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.660301  normal  0.0940885 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4146  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30 
 
 		 474 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.469733 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.43 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0919  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.94 
 
 		 506 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.99 
 
 		 181 aa  45.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.99 
 
 		 274 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3705  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.94 
 
 		 518 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2625  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.94 
 
 		 506 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>