15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1115 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1115  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 106 aa  214  2e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.378995 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2100  cupin region  34.18 
 
 		 119 aa  50.1  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2136  hypothetical protein  26.92 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.0212795 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3841  cupin 2 domain-containing protein  25.96 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325051 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0091  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.38 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.18498 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3324  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1285  cupin region  32.22 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0898  XRE family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 179 aa  43.5  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2919  transcriptional regulator, XRE family  36.71 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1306  transcriptional regulator, XRE family  36.71 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000237827 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1726  cupin 2 domain-containing protein  30.14 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.334039  normal  0.571645 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1690  hypothetical protein  40 
 
 		 118 aa  42  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0136157 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 181 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>