15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2136 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2136  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  221  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.0212795 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3841  cupin 2 domain-containing protein  85.58 
 
 
110 aa  183  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325051 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3324  cupin 2 domain-containing protein  84.62 
 
 
110 aa  183  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1726  cupin 2 domain-containing protein  47.12 
 
 
144 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.334039  normal  0.571645 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2100  cupin region  44.25 
 
 
119 aa  97.8  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0091  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.13 
 
 
113 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.18498 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0205  cupin 2 domain-containing protein  47.52 
 
 
110 aa  93.6  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.633388  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1115  cupin 2 domain-containing protein  26.92 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.378995 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6659  hypothetical protein  46.94 
 
 
173 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0255611 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07738  hypothetical protein  34.55 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05332  AraC-like ligand binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14370)  36.84 
 
 
203 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484672  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1654  hypothetical protein  43.18 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225443  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.72 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0413  Cupin domain protein  42 
 
 
198 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.0398077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>