42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1654 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1654  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  275  2e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225443  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0317  hypothetical protein  75 
 
 		 132 aa  193  6e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.543351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1364  hypothetical protein  63.64 
 
 		 135 aa  177  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0905  cupin 2 domain-containing protein  61.83 
 
 		 133 aa  156  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.52502  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2361  cupin 2 protein  54.55 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.877822  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2075  cupin region  51.49 
 
 		 135 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.83 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3146  cupin 2, barrel  43.2 
 
 		 187 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.515896 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2328  cupin region  44.8 
 
 		 167 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal  0.388933 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46 
 
 		 133 aa  104  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04560  expressed protein  42.4 
 
 		 177 aa  104  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3262  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  41.27 
 
 		 129 aa  103  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.232764  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  42.72 
 
 		 130 aa  103  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06210  mannose-6-phosphate isomerase  40.94 
 
 		 140 aa  100  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  41.18 
 
 		 130 aa  97.8  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.94 
 
 		 186 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1073  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.41 
 
 		 175 aa  94  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000222691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2503  cupin 2, barrel  42.98 
 
 		 202 aa  94  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01258  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0005  YrkC  40.48 
 
 		 182 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05332  AraC-like ligand binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14370)  44.86 
 
 		 203 aa  91.7  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5567  cupin 2 domain-containing protein  39.37 
 
 		 201 aa  88.6  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495662 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2607  cupin domain protein  36.15 
 
 		 190 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0006  YrkC  38.66 
 
 		 167 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2716  cupin domain protein  36.15 
 
 		 190 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00607762  normal  0.0576252 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.59 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.02 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1043  cupin 2 domain-containing protein  39.71 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  26.26 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  26.09 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07738  hypothetical protein  26.79 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  27 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2200  hypothetical protein  29.87 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.192403 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.03 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003224  mannose-6-phosphate isomerase  25.64 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.09 
 
 		 152 aa  41.2  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.7 
 
 		 374 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2136  hypothetical protein  43.18 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.0212795 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3661  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.55 
 
 		 218 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2888  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.91 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  36.11 
 
 		 172 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>