188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2327 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 150 aa  305  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  66.17 
 
 		 138 aa  174  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  60.5 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  64.04 
 
 		 137 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.39 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  56.3 
 
 		 119 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  56.78 
 
 		 120 aa  138  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.73 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  44.23 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  33.91 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.14 
 
 		 119 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.11 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  28.97 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3001  cupin 2 domain-containing protein  34.15 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  35.58 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.91 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  30.51 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0577  hypothetical protein  39.76 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116523  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.71 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.71 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  38.24 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00345  cupin domain protein  31.17 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00219915  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.96 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  30.77 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  28.21 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1757  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.73 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  40.58 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1723  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.19 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.410123  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  34.91 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 204 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3023  cupin 2, barrel  29.41 
 
 		 113 aa  52  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5854  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.154077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 204 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  30.21 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1270  hypothetical protein  37.31 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01320  hypothetical protein  40.51 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333196  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  30.3 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  41.79 
 
 		 190 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2685  cupin 2 domain-containing protein  30.21 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477579  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4993  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.44 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  35.53 
 
 		 163 aa  50.4  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.79 
 
 		 149 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  33.75 
 
 		 115 aa  50.4  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.71 
 
 		 294 aa  50.4  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 421 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1646  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.33 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.62 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.6 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.332449  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.7 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  43.86 
 
 		 333 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.7 
 
 		 172 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3674  cupin 2 domain-containing protein  28.93 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.206207  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0985  oxalate decarboxylase  30.51 
 
 		 405 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.7 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.71 
 
 		 332 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0441  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.49 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0147  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.73 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  36.11 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.06 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4274  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.71 
 
 		 150 aa  48.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  33.75 
 
 		 190 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  27.43 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  32.22 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.68 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.67 
 
 		 167 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  31.65 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0440  cupin 2, barrel  29.47 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351298  normal  0.537185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1358  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.660301  normal  0.0940885 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  24.47 
 
 		 184 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  37.68 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  36.62 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1654  hypothetical protein  26.26 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225443  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2852  cupin 2  29.47 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0347  Mannose-1-phosphate guanylyltransferase  29.59 
 
 		 476 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0851  mate efflux family protein  30.68 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0817404  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0545  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.74 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.84 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  39.39 
 
 		 332 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6318  Methionine--tRNA ligase  39.06 
 
 		 662 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  33.75 
 
 		 311 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.87 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  31.46 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1595  Cupin 2 conserved barrel domain protein  22.86 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.040843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4632  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0666075 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2827  hypothetical protein  37.33 
 
 		 255 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  29.76 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  31.03 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1085  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.29 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.47 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  31.25 
 
 		 163 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2053  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.7 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2200  hypothetical protein  40.74 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.192403 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2394  cupin 2 domain-containing protein  25.93 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00264239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1689  hypothetical protein  26.26 
 
 		 235 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5005  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 255 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>